Problema al unir el gen de interés en el plásmido abierto cuando sus longitudes no son las mismas

Antes de obtener el plásmido recombinante en ADN recombinante, el gen de interés se inserta en un plásmido linealizado mediante ADN ligasa.

¿Qué sucede si la longitud del gen de interés no es la misma que la del espacio en el plásmido abierto? (por ejemplo, mucho más tiempo) ¿Se puede seguir conectando el gen con la brecha o se necesitan otros procesos antes de que el plásmido recombinante pueda volver a colocarse en la bacteria?

Respuestas (1)

Por su pregunta, sospecho que está pensando en el ADN como una molécula muy rígida, no lo es.

El ADN de doble cadena es razonablemente flexible y un modelo mental útil sería pensar en esto como si se ataran los extremos de dos piezas de alambre delgado para formar un círculo.

El ADN de doble cadena puede formar círculos cerrados de menos de 250 pb de largo 1,2 y no creo que haya ningún límite superior conocido; por ejemplo, hay un cromosoma bacteriano circular conocido de 14,782,125 pb de largo 3 .

Un plásmido típico puede acomodar insertos de cualquier tamaño hasta un tamaño total de alrededor de 50 kb, pero los plásmidos que tienen más de 20 kb son muy difíciles de trabajar y pueden requerir técnicas de transformación especiales.

Referencias:

1: Thibault, Thomas et al. "Producción de minicírculos de ADN de menos de 250 pares de bases a través de un nuevo ensayo de circularización de ADN concentrado que permite el diseño de minicírculos con actividad de inhibición de NF-κB". Investigación de ácidos nucleicos vol. 45,5 (2017): e26. doi:10.1093/nar/gkw1034

2: Shore, David, Jorg Langowski y Robert L. Baldwin. "Flexibilidad del ADN estudiada por cierre covalente de fragmentos cortos en círculos". Actas de la Academia Nacional de Ciencias 78.8 (1981): 4833-4837

3: Tierra, Miriam et al. "Perspectivas de 20 años de secuenciación del genoma bacteriano". Genómica funcional e integradora vol. 15,2 (2015): 141-61. doi:10.1007/s10142-015-0433-4