Estoy estudiando la degradación aeróbica de la glucosa y parece que por cada molécula de glucosa deberíamos obtener moléculas. Sin embargo, se sabe que solo obtenemos 6.
(No me voy a centrar en todos los productos y reactivos, sino solo en los importantes para la formación de moléculas de agua)
Primero, en la glucólisis, por cada molécula de glucosa obtenemos dos moléculas de agua, y 2 moléculas de piruvato. Por oxidación de dos moléculas de piruvato obtenemos y 2 moléculas de acetil Co-A. Entonces vamos a pasar dos veces por el ciclo de Krebs, obteniendo y , y requiere 4 moléculas de agua.
Entonces, cuando llegamos a la cadena de transporte de electrones, tenemos un balance negativo de 2 moléculas de agua, y tenemos y . Nos han dicho que por cada una de estas moléculas van 2 electrones a la cadena de transporte de electrones, es decir, un total de 24 electrones van al sistema. El problema viene aquí:
Entonces, teniendo en cuenta que tenemos , se deben formar 12 moléculas de agua, por lo que al final hemos ganado 10 moléculas de agua, pero sabemos que el número de moléculas de agua formadas debe ser 6. Entonces, claramente hay algo mal en mi explicación. Estaría muy complacido si pudiera decirme qué es lo que está mal.
Su confusión proviene enteramente de esta ecuación:
Esta reacción es la combustión de la glucosa. ¡Así no es como se oxida la glucosa en las células! No entiendo por qué tantos textos y cursos de biología presentan esta ecuación al introducir el metabolismo.
De hecho, su seguimiento de las moléculas de agua es correcto: comenzando con una molécula de glucosa, se producen 2 aguas en la glucólisis, 4 se consumen en el ciclo del ácido tricarboxílico y 12 se producen durante la oxidación de NADH/QH 2 ( es decir, FADH 2 ). Esto da un total neto de 10 producidos.
¿Por qué es esto diferente de la combustión de la glucosa? La respuesta está en los oxígenos introducidos por el fosfato inorgánico durante la fosforilación a nivel de sustrato . Considere la reacción neta balanceada para la oxidación biológica de la glucosa (simplificada ignorando el ATP producido por la fosforilación oxidativa y sustituyendo ADP/ATP por GDP/GTP ):
En particular, considere la formación de ATP a partir de ADP y Pi (HPO 4 2- ). En ambas reacciones de fosforilación a nivel de sustrato (catalizadas por GADPH / PGK en la glucólisis y succinato-CoA ligasa en el ciclo del ácido tricarboxílico), el fosfato inorgánico ataca nucleofílicamente al carbonilo activado (tioéster) del sustrato y luego se transfiere a ADP (para formar ATP) :
Los oxígenos del fosfato inorgánico original son de color rojo. El punto clave es que un átomo de oxígeno de HPO 4 2- se transfiere al sustrato. Este oxígeno se elimina posteriormente en forma de dióxido de carbono, mediante descarboxilación oxidativa, durante la conversión de piruvato en acetil-CoA y en el ciclo del ácido tricarboxílico. Esto ocurre cuatro veces por cada molécula de glucosa que ingresa a la glucólisis y se acompaña de la reducción de NAD + a NADH. Dado que el NADH se utiliza para reducir el oxígeno molecular durante la cadena de transporte de electrones:
...esto explica de dónde vienen las cuatro moléculas de agua, aparentemente extra, al comparar la combustión de la glucosa con su oxidación biológica.
Creo que está malinterpretando la intención asumida en la declaración "6 H20 generados a partir de la glucólisis". El número 6 está simplemente en relación con el número de carbonos oxidados a CO2 dentro del TCA... lo que genera un electrón en cada ocurrencia oxidativa, en la que los 6 electrones son luego transportados a OXPHOS que requiere 3 O2 para formar 6 H2O. ... En resumen: siempre que dicen que 6 H20 se producen "aeróbicamente", se refieren específicamente al componente OXPHOS simplificado (o simplemente: C6H12O6 + 6 O2 → 6 CO2 + 6 H2O).
De nota:
La estequiometría es relativamente inútil en la investigación real. No lo pienses demasiado. El metabolismo es increíblemente dinámico.
La participación del H2O en la vida real dentro de la oxidación completa de la glucosa es mucho más compleja: dos vueltas del ciclo TCA generan: 4 CO2 a partir de 2 acetil CoA que requiere 4+ H2O en total, pero solo tiene una pérdida neta de H2O de 4. Citrato sintasa y fumerasa ambas consumen 2 H20 cada uno para permitir la producción de 4 CO2. El H2O restante se usa en aconitasa, pero no se produce pérdida ni ganancia de H2O en esta reacción. La piruvato deshidrogenasa produce los otros 2 CO2 produciendo 6 CO2 en total, pero no requiere H2O en este paso. ... Actividad OXPHOS: (después de 2 turnos de TCA) da como resultado 48 H20 totales producidos entre la ATP sintasa, la citocromo oxidasa y la enolasa, y dado que 4H20 se consumen en el TCA, la producción neta de H20 por glucosa es en realidad 44 H20.
Dos aguas entran en cada vuelta del ciclo del TCA, una en la citrato sintasa y otra en la fumarasa. Además, no creo que sea correcto decir que obtienes agua neta de la glucólisis (de hecho, si observas lo que escribiste, los oxígenos no se equilibran). Creo que lo que te estás perdiendo es que también obtienes un ATP, y el agua que obtienes en el paso 2PG->PEP es realmente parte de la reacción neta ADP + phosphate -> ATP + water
.
Para equilibrar realmente las aguas, debe considerar todos los sustratos y subproductos de la oxidación de la glucosa, incluido el ATP/GTP.
roland
canadiense
Arun Bhardwaj
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