¿Por qué no utilizar SDS-PAGE como método para detectar virus?

Recientemente, he estado investigando sobre el ADN y sé que el método más popular para detectar virus se basa en el ADN. Después de aprender sobre las proteínas, me pregunto ¿por qué no detectamos virus basados ​​en proteínas de virus?

Si se hace realidad podemos ahorrar mucho dinero, en lugar de hacer una reacción PCR, podemos detectar más de una enfermedad en una sola reacción.

Por ejemplo, cuando tengo la secuencia de un virus del NCBI Genebank, puedo saber cuántas proteínas produce el organismo objetivo y puedo calcular el peso molecular de cada proteína. Luego, ejecutándolo en un gel SDS-PAGE para ver cómo se ven las bandas, ¿puedo saber que el organismo objetivo está presente o no?

Por ejemplo, el VIH produce 9 proteínas y el peso molecular de cada proteína es diferente. Entonces, después de hacer la electroforesis, tengo 9 bandas. Según la distancia entre cada banda y según el peso molecular, ¿es posible saber si el VIH está presente o no?

Respuestas (1)

En pocas palabras, la respuesta es que podría buscar detectar proteínas virales, pero debido a que estas proteínas serían componentes muy pequeños de su muestra, tendría que usar una técnica de inmunotransferencia para detectar una proteína viral específica. Si bien la inmunotransferencia es una técnica bastante sensible, creo que es justo decir que puede ser técnicamente exigente. Por el contrario, una reacción de PCR es exquisitamente sensible y bastante robusta. La PCR también es técnicamente más sencilla porque generalmente es más fácil trabajar con el ADN que con las proteínas.

Antes de la llegada de la PCR, la inmunotransferencia habría sido el método de elección.

Además, muchos virus tendrán casi el mismo peso molecular y, por lo tanto, un patrón SDS PAGE casi idéntico.
Punto de @AlanBoyd, comentario eliminado.
Absolutamente correcto. Y para la ventaja de "más de una enfermedad", esto puede, y se hace de forma rutinaria, con qPCR, con una sensibilidad mucho más alta que puede obtenerse razonablemente a través de western o incluso ELISA (que es un sistema de detección viable a menudo basado en proteínas ) .