¿Por qué las reacciones catalizadas por enzimas son más lentas a menor concentración de sustrato?

Supongamos que estoy usando 200 nmoles de enzima y 2 mmoles de sustrato. La enzima debe estar saturada pero si uso 50 mmoles de sustrato, la reacción será más rápida. ¿Por qué? ¡Simplemente no puedo conseguirlo! Incluso a una concentración más baja de sustrato, la enzima está saturada (todas las moléculas de enzima participan en la reacción), pero aún así la velocidad de reacción es más baja.

Respuestas (2)

La respuesta de Alan Boydcubre bastante bien los aspectos mecanicistas, pero hay otro aspecto que no tocó del todo: lo que sucede a nivel molecular. Para comprender esto, debe pensar en las condiciones reales de la reacción: a menos que se lleve a cabo dentro de una célula, lo que casi nunca ocurre en las reacciones bioquímicas directas del tipo del que está hablando, entonces la enzima, el sustrato y el producto son todos flotando alrededor en una cierta concentración. La reacción enzimática avanza bien y, a medida que el bolsillo de unión del sustrato se libera, el producto se disocia de la enzima y se difunde, lo que permite que otra molécula de sustrato ocupe su lugar y ocurra la siguiente reacción. Esta es la situación en su nivel de 2 mmol [sustrato]. A 50 mmol, la concentración de sustrato es mucho mayor,

Creo que entiendo lo que dices, pero no entiendo tu concepto de "concentración local bastante baja " . La concentración es una propiedad intensiva de un sistema, es lo que es.
@AlanBoyd: lo reformulé un poco y eliminé la referencia un tanto confusa a local al principio. Cuando comenzaba a escribirlo, iba a tratar de explicar cierto fenómeno de algunas reacciones (las concentraciones de sustrato muy altas en realidad pueden conducir a una ralentización de la reacción, ya que el sustrato se produce más rápido de lo que puede difundirse, inhibiendo la enzima), luego me di cuenta de que la pregunta no se trataba realmente de eso y cambié la dirección en la que iba, pero no todas las palabras. ¡Gracias por atrapar eso!
¡eso es todo! Creo que esta es la respuesta que estaba buscando. Gracias.

En términos de la cinética de Michaelis-Menten, la velocidad nunca alcanza la velocidad máxima:

v = V metro a X × S k metro + S

dónde S es la concentración de sustrato. Note que por grande que sea S es, el término en la línea inferior ( k metro + S ) será mayor que S , asi que v será menor que V metro a X .

Puede pensar en esto en términos del equilibrio de unión entre la enzima y el sustrato:

mi + S mi S

Dado que es un equilibrio, nunca puede estar completamente hacia el lado derecho.

Esta es la razón por V metro a X siempre se determina por extrapolación. En la práctica, por supuesto, a concentraciones muy altas de sustrato:enzima, sus mediciones tendrían que ser muy precisas para ver la diferencia: si S es 100 × k metro usted está viendo una diferencia del 1%. En su ejemplo hipotético, no menciona cuál es el valor de k metro es.

No entendí la última parte, ' En la práctica, por supuesto, a concentraciones muy altas de sustrato: enzima, sus mediciones tendrían que ser muy precisas para ver la diferencia: si S es 100 × Km, está viendo una diferencia del 1%. En su ejemplo hipotético, no menciona cuál es el valor de Km. '
@Tytoalba el valor absoluto de Km no importa porque simplemente estoy reemplazando S con (100*Km) en la primera ecuación. Mi última oración es solo para decir que el OP da valores de S pero no de Km, por lo que no podemos juzgar dónde estamos en la curva.