Modularidad de los factores de transcripción

Asistí a un seminario sobre neurogénesis que presentó resultados para PAX6 como un TF importante que contiene 3 dominios con patrones muy distintos de expresión descendente. El ponente terminó diciendo que PAX6 puede considerarse como 3 TF en una proteína, actuando de forma independiente en diferentes situaciones:

Funciones relativas de los diferentes dominios Pax6 para el desarrollo de células alfa pancreáticas

¿Alguien sabe de más ejemplos como este?

interesante: he oído hablar de factores de transcripción 'genéricos' que actúan sobre muchos genes a través de motivos de secuencia comunes (por ejemplo, las proteínas de unión al potenciador de CCAAT), pero no factores que en realidad tienen diferentes motivos con diferentes efectos posteriores. También estoy interesado en esto.

Respuestas (2)

La familia de factores de transcripción NF-κB es muy modular, con diferentes combinaciones que tienen diferentes efectos. El TF activo (nuclear, unido a ADN) es un dímero compuesto de diversas subunidades RelA/p65 , RelB , c-rel , NFKB1/p50 y/o NFKB2/p52 . Por ejemplo, el dímero p65/p50 "canónico" se activa en respuesta a estimulantes como TNF-α (factor de necrosis tumoral alfa, liberado en respuesta a señales inflamatorias como la presencia de patógenos) y LPS (lipopolisacárido de las paredes celulares de Gram- bacterias negativas ), mientras que el dímero RelB/p52 juega un papel importante en el desarrollo de las células B(el componente del sistema inmunitario que produce anticuerpos). El factor de transcripción AP-1 también es heterodimérico y contiene proteínas de las familias Jun, Fos, JDP y ATF, y hay muchos otros ejemplos de complejos de factores de transcripción multiméricos. Este artículo reciente en Nature Immunology (descargo de responsabilidad: no participé en esa investigación, pero mi antiguo laboratorio hizo un trabajo similar) muestra la unión específica de la secuencia de ADN por parte de diferentes dímeros de NF-κB.

El polimerismo en general, y el dimerismo en particular, son modos bastante comunes de activación y regulación transcripcional. La gran cantidad de formas en que se puede combinar un número relativamente pequeño de factores de transcripción permite un control exquisito de los genes, respondiendo a una gran variedad de situaciones celulares. Desafortunadamente, también significa que las mutaciones en componentes clave y comunes pueden dar como resultado la transformación, el crecimiento sin restricciones y la generación de tumores.

Hubo un artículo publicado en Cell el año pasado que demostró que el motivo de unión de un factor de transcripción Hox cambiará dependiendo de si hay un cofactor unido a Hox.

Slattery et al. (2011) La unión del cofactor evoca diferencias latentes en la especificidad de unión al ADN entre las proteínas Hox . Móvil , 147 (6) 1270-1282. doi: 10.1016/j.cell.2011.10.053 ( pdf )