Heterocigosidad y sobredominancia

Considerar metro loci con ventaja heterocigota (sobredominancia) tal que la aptitud de los dos homocigotos es 1 s 2 y la aptitud de los heterocigotos es 1 + s 2 , dónde s > 0 . Supondremos que la aptitud de un individuo viene dada por la multiplicación del componente de aptitud en cada locus. En consecuencia, la aptitud del mejor genotipo posible viene dada por ( 1 + s 2 ) metro .

Según este libro , un individuo es heterocigoto en j de estos metro loci con probabilidad

( metro j ) ( 1 2 ) metro

y la aptitud media de la población de equilibrio w ^ es

w ^ = j = 0 metro ( metro j ) ( 1 2 ) metro ( 1 + s 2 ) j ( 1 s 2 ) metro j = 1

¡No entiendo ninguna de estas dos ecuaciones! ¿Pueden ayudarme a entender cómo se han calculado?


Por el momento solo disfruté demostrando que w ^ = 1 . Podemos reformular w ^ como

w ^ = ( 1 2 ) metro j = 0 metro ( metro j ) ( 1 + s 2 ) j ( 1 s 2 ) metro j = 1

, luego usando la identidad binomial

w ^ = ( 1 2 ) metro ( ( 1 + s 2 ) + ( 1 s 2 ) )   metro
w ^ = ( 1 2 ) metro 2 metro
w ^ = 1

Estoy tomando otra puñalada en esto. Creo que las derivaciones en las referencias son más simples y, en general, es una pregunta interesante.

Respuestas (1)

Si la aptitud de un heterocigoto es ( 1 + s / 2 ) y de un homocigoto es ( 1 s / 2 ) entonces, ¿por qué la probabilidad de un estado dado ( 1 + s / 2 ) j ( 1 s / 2 ) metro k

( metro j ) ( 1 / 2 ) j ( 1 / 2 ) metro j = ( metro j ) ( 1 / 2 ) metro     ?

Como señaló anteriormente, en el caso general no tiene por qué ser cierto que pag = q = 1 / 2 pero eso es lo que implica la forma de la probabilidad anterior. Entonces, la pregunta del umbral es por qué este modelo heterocigoto-dominante en particular implica probabilidades de equilibrio pag = q = 1 / 2. Creo que las ideas a continuación comienzan a abordar esto.

El caso más simple es para un locus, dos alelos, y hay muchas buenas derivaciones en línea. Creo que si comprende la situación de un locus, puede generalizar a números más altos. (Con suerte complementaré esta respuesta, si el tiempo lo permite. Creo que un atajo sería asumir pag = q = 1 / 2 y usa tus pesas de fitness. eso nos da w ¯ = 1 como denominador. Ahora, por razones de simetría, creo que puedes demostrar que las frecuencias relativas de pag y q son iguales y asi pag = pag . Entonces tienes que demostrar que esta solución de equilibrio es única.)

Para un solo locus, las derivaciones de 'ventaja heterocigota' que he encontrado, (1) (2) , asignan pesos de aptitud de la siguiente manera:

AA = (1 - s), Aa = 1, aa = (1 - t )

en el cual s , t > 0 , s t en general, de donde se derivan como condición de equilibrio

Δ q = pag q ( s pag t q ) W ¯ = 0

entonces

pag ^ = t s + t       y       q ^ = s s + t

en el cual pag ^ , q ^ son frecuencias de equilibrio para cada alelo, respectivamente, y s y t son tasas de mutación. En ninguna parte vi un modelo en el que hubieran asignado la misma aptitud a ambos casos de homocigotos (AA, aa) pero es solo un caso especial del modelo de ventaja de heterocigotos.

aptitud (AA) = aptitud (aa) = (1 - s/2), aptitud (Aa) = (1+ s/2).

Entonces, si restamos s/2 de cada puntaje de fitness (o normalizamos con respecto a Aa con el mismo efecto), obtenemos:

aptitud(AA) = aptitud (aa) = (1-s) y aptitud (Aa) = 1 como en las dos referencias anteriores, excepto que ahora los dos estados homocigotos tienen la misma aptitud.

Pero entonces tenemos

Δ q = pag q ( s pag s q ) W ¯ = pag q s ( pag q ) W ¯

y la única solución no trivial es pag = q = 1 / 2.

Entonces, lo que estoy sugiriendo es que cuando asignas la misma aptitud a ambos A A y a a ya no tienes el caso general. En cuanto al valor de s siendo forzado, lo siguiente parece relevante.

La expresión completa de (2) para la condición de equilibrio es

pag = pag 2 W A A + pag q W A a W ¯ ( 1 )

en el cual W A A = W a a = 1 s y W A a = 1 y

W ¯ = pag 2 W A A + 2 pag q W A a + q 2 W a a

Si a los homocigotos se les asigna la misma aptitud y pag = q = 1 / 2 , la ecuación (1) anterior se convierte en:

pag = 1 4 + 1 4 ( 1 s ) 1 2 + 1 2 ( 1 s )

El programa en la página 583 de (1) es útil. Sean h:= heterocigotos y m:= homocigotos. Si pag = q = 1 / 2 entonces, siempre que la aptitud (h) y la aptitud (m) sean iguales, el sistema está en equilibrio inmediatamente.

Si pag 1 / 2 entonces mientras f(h) = f(m) el sistema alcanza el equilibrio en pag = 1 / 2 asintóticamente. Si pag = 1 / 2 pero f(h) f(m) se debe calcular el límite asintótico.

Ver también http://evol.bio.lmu.de/_teaching/evogen/Evo8-Summary.pdf

Muchas gracias por tu respuesta. Estoy de viaje ahora mismo y no tengo tiempo para leer tu respuesta. Lo leeré el miércoles o el jueves probablemente.
Gran respuesta. Además de su otra respuesta (ahora eliminada por usted mismo), respondió perfectamente a mi pregunta. Gracias. +1
@Remi.b: Agradezco los comentarios. Fue una pregunta interesante y todavía estoy aprendiendo sobre este amplio tema.