¿Existe algún estándar de formato de archivo para los datos de EEG?

He comenzado a investigar un poco sobre el análisis de EEG. Una de las cosas desafiantes que he encontrado es la variabilidad en los formatos de los archivos EEG.

¿Qué hace cuando recibe datos que su software no admite? ¿Es razonable pedir a los colaboradores que conviertan los datos a otro formato? ¿Modifica su software para incorporar los detalles del nuevo formato?

¿Existe algún formato de EEG que se considere estándar? ¿Los fabricantes de EEG proporcionan convertidores a ese formato en su software?

Gracias,

-drd

Si dices cuál es el formato de tus datos exactamente, será más fácil ayudarte.
Mi punto es que tengo datos que vienen en muchos formatos diferentes. El actual es .eeg (procedente de máquinas nicolet).

Respuestas (2)

Hasta donde yo sé, la respuesta corta es no: no existe un estándar de oro para los archivos EEG. Pero EEG es una serie temporal (amplitud) de varios canales. Entonces, la forma más común de representarlo son las columnas como electrodos y las filas como puntos de tiempo. Creo que casi todo el software es posible leer una estructura como un archivo txt. Pero EEG no es solo una serie temporal. Por lo general, es importante tener un canal adicional con marcadores de eventos. Hace que la situación sea un poco complicada. Pero, por lo general, el software popular puede leer la mayoría de los formatos de datos de EEG y no es difícil escribir una función personalizada para leer sus datos.

Gracias. Es fácil si tiene una especificación del formato con el que está tratando. Pero si ese es el caso, entonces ese tipo de archivo probablemente sea compatible con los diferentes proyectos de código abierto de análisis de huevos. ¿Supongo que no toda la compañía proporciona detalles de sus formatos de archivo?
Mira este guión. sccn.ucsd.edu/pipermail/eeglablist/2004/000565.html Tal vez funcione para usted. Pero creo que puede ponerse en contacto con el fabricante para obtener la especificación de su archivo de datos.
Aquí hay algunos tutoriales sobre cómo puede usar FieldTrip para cargar diferentes tipos de datos de EEG.

Usted habla sobre el desafío de la variabilidad en los formatos de datos de EEG --- Si bien (desafortunadamente) no estoy al tanto de un formato de datos de EEG estándar, hay intentos de estandarizar la forma en que se pueden compartir los datos de EEG:

La estructura de datos de imágenes cerebrales ( BIDS ) intenta aclarar la estructura de directorios y metadatos necesarios cuando se comparten datos de neuroimagen. BIDS comenzó para datos de MRI (con el formato NIfTI como formato de datos estándar) y hasta ahora no está completamente especificado para datos de EEG (en parte, porque aún no existe un formato de datos estándar).

Sin embargo, hay un proceso en curso para hacer una extensión de BIDS para EEG .

EDICIONES:

  • Tesis relacionada con la diversidad de formatos de datos EEG
  • Artículo de revista sobre un nuevo intento de especificar un formato estándar (aunque para todos los datos neurológicos)