Enzima de restricción tipo II [cerrado]

¿Por qué una enzima de restricción de tipo II no puede cortar un ácido nucleico con la siguiente composición de bases?

A: 28% C: 15% G: 35% T: 22%

Realmente no entiendo su pregunta... Primero, una enzima de restricción cortada en el sitio de reconocimiento, nunca escuché sobre la distribución del contenido de base (¿puede vincular una fuente?) Segundo, en cualquier secuencia de ADN, el porcentaje de A es igual al porcentaje de T y lo mismo es cierto para C y G. ¿Qué rey de la secuencia de ADN puede tener 28%T y 22%T? Así que debe ser ARN de lo que estás hablando. Pero entonces T no es correcto, debería ser U. Agregue más detalles a su pregunta.
Bienvenido a Biología.SE. Para mí, esto parece una pregunta de tarea (esas están fuera de tema aquí, vea el enlace), así que le puse una bandera. Esfuércese por responder la pregunta usted mismo, si desea evitar que la pregunta se elimine/cierre. ¿Qué sabes sobre la enzima? ¿Qué te dice la composición base sobre la secuencia en cuestión? Básicamente, háganos saber que lo está intentando. ¡Gracias!

Respuestas (1)

Supongo que esto es una tarea, no una curiosidad genuina. Siendo ese el caso, voy a darte dos respuestas diferentes aquí: la estándar, que es la que creo que tu profesor/profesor espera ver, y una más complicada en el anexo .

Lo primero que llama la atención en la pregunta son los porcentajes base. Claramente, no sigue la famosa regla de emparejamiento de Watson-Crick (A se empareja con T, G se empareja con C) y, por eso, no vemos la regla de Chargaff en este ácido nucleico.

Por lo tanto, este no es un ADN de doble cadena (dsDNA), sino un ADN de una sola cadena (ssDNA).

Dicho esto, la respuesta a esa pregunta puede ser algo así:

Un RE tipo II no puede cortar ese ácido nucleico porque es un ssDNA.

Apéndice:

Hay una complicación aquí, que puede hacer que la respuesta anterior sea cuestionable.

Las enzimas de restricción de tipo II solo escinden ADN regular , es decir, de doble cadena. Por lo tanto, no pueden dividir los ssDNA, lo que corrobora la respuesta que acabamos de dar.

Pero el problema es que los ssDNA pueden formar estructuras de bucle, en las que hay emparejamiento entre bases en la misma hebra. En esas estructuras, el ADN es técnicamente dsDNA y, como tal, puede ser escindido por RE Tipo II. Por ejemplo, eche un vistazo a este artículo: Las endonucleasas de restricción de tipo II escinden los ADN monocatenarios en general .

Dicho esto, el tipo II RE, de hecho, escinde ssDNA (en lugares donde ssDNA forma bucles y estructuralmente se parece a un dsDNA), lo que hace que la pregunta en sí no tenga sentido.

De hecho, es una tarea, el porcentaje base solo podría ser posible si se refiere a un ssDNA. Por tanto, ¿la respuesta podría estar relacionada con los palíndromos? Aunque no podemos decir nada sobre el sitio de reconocimiento
Creo que vale la pena explicar que, al menos según el artículo al que se hace referencia en la respuesta, el corte observado de un ADN de fago monocatenario se debe a la formación de dsDNA en estructuras de bucle de tallo. Esto puede parecer pedante, pero claramente, desde el punto de vista de las enzimas de restricción, el sustrato sigue siendo dsDNA.
Enzima de restricción tipo II [cerrado]
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