Energía potencial gravitatoria definida como el trabajo realizado sobre una masa

...si la aceleración es$0$significa que la fuerza externa es$0$...

No. Si la aceleración es$0$entonces la fuerza neta es$0$.

... y, por lo tanto, el trabajo neto realizado siempre debe ser cero.

Sí, en este escenario la red es de hecho$0$, ya que la fuerza neta es$0$. Sin embargo, esto significa que hay (al menos) dos fuerzas que actúan sobre el objeto en cuestión: la gravedad$F_g$y una fuerza externa$F_e$. Estas dos fuerzas deben ser iguales y opuestas.

Este es un tratamiento/explicación estándar de la energía potencial. Movemos el cuerpo con una velocidad constante, como$F_g=-F_e$, por lo que el trabajo realizado por la fuerza externa$W_e$es igual al negativo del trabajo realizado por la gravedad$W_g$. Por definición, el trabajo realizado por la gravedad también es igual al cambio negativo en la energía potencial$\Delta U$. Finalmente, si comenzamos "en el infinito" donde$U(\infty)=0$y terminar en la posición$x$, entonces$\Delta U=U(x)-U(\infty)=U(x)$,

Por lo tanto, tenemos

La energía potencial gravitacional es el trabajo realizado al llevar una unidad de masa desde el infinito hasta un punto sin aceleración.