¿Cuáles son algunos ejemplos de redes ponderadas no dirigidas en ecología?

Soy estudiante de matemáticas con un interés actual en la teoría de redes. Una red se puede considerar como una colección de nodos , y los bordes entre estos nodos significan alguna relación entre ellos. El ejemplo más omnipresente sería una red social como Facebook con nodos que representan a personas y un borde que conecta dos nodos si son amigos.

Una red se llama dirigida si los bordes tienen una dirección. Esto significa que si hay un borde dirigido de A a B, no es lo mismo que un borde de B a A. Un ejemplo de esto sería una red de red alimentaria, donde los nodos representan especies y un borde de especies A a B significa que A se come a B. Obviamente, esto no significa necesariamente que haya una ventaja entre B y A (rara vez la presa se come al depredador).

Una red se llama no dirigida si no está dirigida, es decir, ninguno de los bordes tiene dirección alguna; si hay una arista de A a B, necesariamente significa que hay una arista de B a A.

Ahora, uno puede asignar pesos (valores numéricos) a los bordes de una red para indicar la importancia relativa de los bordes. En el ejemplo anterior de Facebook, esto se puede considerar similar a asignar valores a los bordes que indican la fuerza de la amistad/distancia entre las residencias de los amigos, etc.

Deseo estudiar redes ecológicas para ver si puedo hacer inferencias interesantes a partir de mi estudio de redes ponderadas.

Entonces, ¿puede darme algunos ejemplos de redes ecológicas no dirigidas y ponderadas ?

La teoría de redes encuentra una amplia aplicación en ecología trófica (redes alimentarias) y genética (redes reguladoras de genes). Echa un vistazo a eso.
Las redes de interacción/red alimenticia en las que solo conocemos las correlaciones entre especies (p. ej., correlaciones entre la abundancia de especies a lo largo del tiempo) serían un ejemplo de una red ponderada no dirigida.

Respuestas (1)

La epidemiología, la propagación de enfermedades, es probablemente una de las aplicaciones más famosas de la teoría de redes en biología, y se remonta a John Snow.

Un ejemplo más relevante podría ser algo así como modelos gráficos de mosaicos de hábitats . Las poblaciones a menudo se distribuyen por los paisajes y se agrupan en pequeños focos de hábitats adecuados. Si bien están fragmentadas, estas poblaciones todavía tienen una cierta cantidad de contacto, lo que da como resultado un flujo de genes y la creación de lo que a menudo se denomina metapoblación. Estas cosas pueden suceder en una amplia gama de escalas, desde su patio trasero hasta continentes enteros, pero al modelarlos como gráficos, todos pueden estudiarse comparativamente y probarse para determinar su resiliencia frente a perturbaciones, pérdida de hábitat, etc.

Mencionas las redes sociales, pero no hay ninguna razón por la que no puedas estudiar lo mismo en poblaciones animales.. Digamos que un individuo aprende algo útil, tal vez la ubicación y la ruta a un rico lugar de alimentación. Luego, esa información se puede compartir con otras personas, ya sea mostrando y contando, o tal vez mediante algún tipo de comunicación abstracta. La información se difunde de manera exponencial familiar hasta que todos saben, luego cualquiera de esos individuos puede transmitir o ser "escuchado" por una población vecina, ni siquiera tiene que ser la misma especie en algunos casos, y la información fluye. otra vez. Al igual que con los mosaicos de hábitat, el beneficio de estos modelos es que se pueden comparar y probar sistemas muy diferentes en igualdad de condiciones, desde peces hasta aves, mamíferos e incluso algunos insectos sociales, se prestan bien a esto.

Comenzó a trabajar en una respuesta, luego decidió simplemente votar esta. Algunas redes no dirigidas y ponderadas para epidemiología se pueden encontrar en ndssl.vbi.vt.edu/synthetic-data , o como componente del paquete ergm R, si así lo desea.