Estoy aprendiendo sobre proteínas y necesito entender este concepto. ¿Qué hace que esta colorida bola de garabatos sea identificable? ¿Por qué es una proteína y no cualquier otra biomolécula (como el ADN, por ejemplo)? ¿Qué muestran los colores? ¿Cuáles son las variaciones en la forma de la imagen?
Básicamente, la pregunta es: ¿Qué está tratando de decirme esta imagen sobre esta proteína?
Esta es una forma común de ilustrar una proteína y, a menudo, se denomina "caricatura de proteína". Hay otras formas comunes de ilustrar las proteínas.
Esta caricatura le muestra dónde están las hélices α (espirales) y dónde están las láminas β (flechas), que son elementos estructurales importantes. Las cuerdas que conectan esos elementos estructurales son regiones de "bucle" flexibles.
Si desea comparar esto con otras estructuras y ver qué proteína es, consulte PhyreStorm. Necesitará el archivo PDB, no solo una imagen.
La coloración también es común. El N-terminal (el primer aminoácido) es de color azul, y los colores van a través del arcoíris hasta el rojo, el C-terminal (el último aminoácido en la cadena polipeptídica).
Aunque esta pregunta ha sido respondida (y la respuesta aceptada), quiero agregar algo sobre el lenguaje científico y la convención.
El lenguaje en general es un medio de comunicación que permite a las personas compartir las ideas que tienen dentro de sus mentes. El lenguaje científico se utiliza para compartir conocimientos científicos entre personas, y además de la comunicación verbal y escrita, también utiliza dibujos de todo tipo para ilustrar mejor ideas complejas que suelen ser invisibles a simple vista (ya se trate de moléculas en química, biología microsistemas en biología, fuerzas en física, etc.).
La imagen en cuestión representa la forma convencional de representar la estructura de una proteína, y esta convención ampliamente aceptada se caracteriza por ciertos colores y formas, como se indica en la respuesta anterior. Me imagino que cualquiera que vea este tipo de representación por primera vez no sabrá de inmediato que se trata de una interpretación informática de una proteína, porque nadie sabe cómo es una sola proteína antes de estudiarla. Pero una vez que te dicen que es una representación de una proteína, la aceptas y la " etiquetas " en tu mente, para que la próxima vez que la veas, ya sepas que así es como "debería" verse una proteína.
Y cuanto más lo estudias, más natural se vuelve este lenguaje para ti.
Jaime
MattDMo
gileain
Jaime