¿Cómo se ubicaban los genes antes del desarrollo de la bioinformática?

Me gustaría saber el procedimiento detallado de cómo los científicos en un tiempo anterior pudieron localizar genes como nosotros pudimos localizar el gen de Huntington en 1983.

¿Podría aclarar qué quiere decir con tiempo anterior? ¿Está preguntando cómo se ubicó el Huntington o antes de que se ubicara y en qué organismo? ¿Y qué crees que tiene que ver exactamente la bioinformática con esto? ¿Qué investigación ha hecho usted mismo para encontrar la respuesta y por qué no comienza su título con una letra mayúscula como casi todos los demás y realiza una revisión ortográfica si el inglés no es su primer idioma?
El procedimiento detallado de cómo los científicos localizaron el gen de la huntingtina abarca al menos una década e incluye varios artículos, por lo que su pregunta parece bastante amplia. Se asignó al cromosoma 4 en 1983 , pero el ORF completo, con repeticiones CAG, no se identificó hasta 1993 .
Su pregunta también es amplia, ya que a menudo se usaban diferentes técnicas para diferentes genes. Consulte esta respuesta para obtener un breve resumen de cómo se descubrió el gen de la insulina.

Respuestas (2)

Los primeros mapas del genoma se construyeron a partir de Escherichia coli abusando de la conjugación de mutantes Hfr especiales. Supongo que está algo familiarizado con la conjugación bacteriana , el proceso de transferencia de material genético entre células bacterianas.

Por lo general, solo se transfieren plásmidos móviles . Llevan los tra -genes necesarios para la construcción del sistema sex-pilus, replicación y transferencia. También necesitan el sitio oriT (origen de la transferencia), en el que se inicia la transferencia. Un plásmido móvil famoso es el plásmido F.

Algunas células mutantes integraron el plásmido F en su cromosoma principal mediante recombinación. Por lo tanto, pueden transferir todo su genoma a una célula receptora. Estas cepas se denominan cepas Hfr (alta frecuencia de recombinación) y se utilizaron intensamente en los primeros mapas del genoma.

Descubrieron que una cepa Hfr tarda aproximadamente 100 minutos en transferir todo su genoma a otra célula. Al interrumpir la conjugación (por ejemplo, mediante agitación vigorosa), se interrumpió la transferencia y el genoma pudo dividirse en secciones por tiempo de transferencia (10 min, 20 min, 30 min, etc.).

La función de los genes (o secciones del genoma) se reveló cruzando cepas Hfr con mutantes defectuosos. Si el mutante no podía crecer en sacarosa, por ejemplo, se realizaban varios experimentos de conjugación con diferentes tiempos de apareamiento. Cuando un mutante pudo volver a crecer en sacarosa después del apareamiento, se comprobó el tiempo de transferencia. Si la cepa podía volver a crecer después de 30 minutos de conjugación, pero no después de 20, sabían que los genes necesarios para el crecimiento de la sacarosa se encontraban en la región de 20 a 30 minutos.

Se necesitó una cantidad minuciosa de experimentos con una amplia gama de mutantes para construir el primer mapa de genes de E. coli , pero se logró incluso antes de que se conocieran las secuencias de nucleótidos.

Solo para complementar a Pythagyros.

La secuenciación y la bioinformática ya existían en 1983, de hecho, Frederick Sanger y sus colegas publicaron su método automatizado de secuenciación (secuenciación de Sanger) en 1977. Publicaron la secuencia completa del bacteriófago φX174. Otros métodos de secuenciación de ADN habían existido desde el primero en 1970 establecido por Ray Wu.