¿Cómo se determina la dirección de transcripción de la ARN polimerasa?

Cuando los factores de transcripción se unen a la cadena de ADN, ¿cómo saben en qué dirección tienen que iniciar la transcripción por la polimerasa de ARN? ¿Se lee siempre en la misma dirección de todos modos? ¿Qué pasa con esos 'promotores'? ¿Influyen en la dirección de la transcripción?

¿Quiere decir por dirección cuál de las dos cadenas de ADN se transcribe? ¿O quiere decir si la polimerasa va de 5 'a 3', o de 3' a 5' en una sola hebra?
@MadScientist Aunque la primera pregunta también es interesante, la segunda es la que me interesa en este momento.

Respuestas (1)

La transcripción siempre procede en la dirección 5' (5-principal) a 3' (3-principal) en la hebra codificante del ADN. La unión de los factores de transcripción y la ARN polimerasa al ADN depende de los motivos de secuencia en el ADN. La transcripción siempre ocurre en la misma dirección con respecto a la estructura química de la hebra de ADN codificante, mientras que la dirección de la transcripción con respecto a la estructura del cromosoma depende de en qué hebra se encuentra la secuencia codificante (y, por lo tanto, qué hebra se define como la cadena). cadena codificante de ese gen).

Solo para aclarar, RNAP se mueve en relación con la hebra de plantilla de 3 'a 5'. El transcrito se polimeriza de 5' a 3' y tiene la misma secuencia que la cadena codificante (excepto U en lugar de T).
Gracias, buen punto. Todo el proceso se describe, con cifras, en un libro en línea del NCBI aquí: ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK22085
Me alegra escuchar eso. También puede comunicar que una respuesta es útil haciendo clic en la marca de verificación junto a la respuesta, "aceptándola".
No creo que la transcripción siempre vaya 5 ′ → 3 ′ wrt a la cadena de codificación. Ver en.wikipedia.org/wiki/…
En ese caso, hay dos cadenas de codificación, por lo que la transcripción sigue siendo la misma con respecto a cada cadena de codificación.
¿Qué pasa con el ssRNA de sentido negativo en los virus?
Creo que durante la replicación había una subunidad que aseguraba la direccionalidad, pero no recuerdo cuál. ¿Quizás ocurre una situación similar en la transcripción?
Creo que lo más importante que hay que entender aquí es cómo estas enzimas "saben" qué hacer. Me parece fascinante que la polimerasa pueda moverse hacia atrás para realizar correcciones de errores. ¿Cómo saben que hacen eso? ¿Hay algún tipo de software biológico en una enzima que les diga cómo hacer estas cosas?
user38945 "tiene razón". En serio: cualquier "promotor" es solo un grano de arena en la hebra, es cierto que hay - derecha o izquierda, de "ese" promotor - algunos nucleótidos que definen "su" dirección, es decir, su dirección. (Con mis matemáticas, dos de ellos serían suficientes (ya que Polymerase es un pony truco, lo hace del '3 al '5, siempre lo hace).)
¿Cómo se determina la dirección de transcripción de la ARN polimerasa?
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