Ahora mismo estoy haciendo un cladograma (más bien un dendrograma) para un reino de especies ficticias, y no estoy exactamente seguro de cómo representar una determinada relación.
Digamos que la clase más antigua del reino es el Clado A. Y, si bien es un clado en sí mismo, también evolucionó hacia otras dos clases. La primera clase en la que evolucionó fue el Clado B, pero el Clado A aún persiste. Luego, más adelante, el Clado A evoluciona hacia el Clado C, pero aún persiste.
Si tuviera que representar esto en un dendograma, ¿cómo se haría?
La respuesta corta es que los cladogramas no son compatibles con la taxonomía linneana.
La respuesta más larga explica cómo y por qué. Primero, no hay suficientes rangos en la taxonomía linneana para cubrir todos los nodos del cladograma. El "reino-filo-clase-orden-familia..." se basó originalmente en la similitud y no en la relación filogenética. Por ejemplo: la clase Reptilia ya no es un clado, y la clase Aves es un subclado del orden Sauroschia (del "super"-orden Dinosauria, que es un clado de Diapsida que incluye reptiles y cocodrilos modernos). Los pájaros (aves) son descendientes evolutivos de los dinosaurios, pero Linneous los clasificó como una clase, mientras que los dinosaurios, según la taxonomía linneana, eran como mucho un superorden.
Por lo tanto, debe elegir: un árbol de relaciones pseudo-linneano o un árbol filogenético de cladograma (y luego debe omitir los nombres de los rangos "clase", "orden", etc.
Intentaré dibujar el árbol que describiste:
A | |-- B |-- C | . . .
SelloBoi
Triceratops
Triceratops