Estoy aprendiendo acerca de las expresiones genéticas y la regulación. Varias investigaciones se centran en encontrar los genes de expresiones génicas alteradas en un microarreglo para afirmar que tienen una correlación con una enfermedad específica.
Estoy confundido acerca de cómo las personas pueden determinar si un gen está regulado negativamente o regulado positivamente por su expresión genética.
Supongamos que tenemos algunas muestras de un gen: algunas de las muestras son muestras de pacientes normales y el resto son muestras infectadas por enfermedades. ¿Determinamos la dirección de regulación de un gen por la proporción de expresión génica de muestras normales/infectadas con enfermedad?
Por ejemplo, si la proporción de expresiones es un valor negativo, ¿decimos que el gen es un gen regulado negativamente, de lo contrario, es un gen regulado positivamente?
Si tiene valores de expresión de control y, por ejemplo, valores de expresión de enfermedades , se toma la relación: . Si es mayor que uno, está regulado al alza. Por lo general, la relación logarítmica se calcula: . Ahora, si esto es positivo, el gen está regulado.
Los valores de expresión génica generalmente se miden en todo el genoma y luego se normalizan antes de calcular las proporciones. Por lo tanto, rara vez trata con valores de expresión sin procesar individuales.