¿Los represores de fagos CI y Mnt exhiben diafonía?

Estoy interesado en utilizar las proteínas CI y Mnt, así como sus respectivos promotores (pR y Pmnt) dentro del mismo sistema sintético, pero me preocupa su similitud y su potencial diafonía. Una búsqueda rápida en la literatura no arrojó resultados y Multalin mostró cierta homología de secuencia significativa (aunque Mnt forma un homodímero mientras que CI no lo hace).

CI y Mnt Multalin

pR y Pmnt Multalin

Secuencias: CI y pR , represor Mnt y promotor Mnt

¿Se ha informado alguna vez que el represor CI o Mnt presenta diafonía en los promotores pR y Pmnt?

Respuestas (1)

Todavía no hay informes para ello. No creo que solo porque muestren una homología general, exhiban diafonía. Solo vea la alineación de los dominios de unión al ADN de estas proteínas primero ~ 70 residuos de N-terminal. Además, sus DBD pertenecen a diferentes familias de PFAM.

De manera similar con las secuencias del promotor. Como se informó en el sitio web de iGEM:

  • Promotor de menta:tagatctcctatagtgagtcgtattaattt

  • cI promotor:gtgttgactattttacctctggcggtgata

Son bastante diferentes. Además, si iGEM tiene una parte estándar informada, como un componente de sistema biestable: promotor Mnt/cI ( BBa_K228003 ), entonces habría sido bastante estandarizado. Las piezas iGEM suelen ser fiables.

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