¿Cómo cuantifican los biólogos la "expresión génica" en los experimentos?

He leído artículos que contienen afirmaciones como "el control de la expresión génica es fundamental en los procesos biológicos".

¿Cómo se cuantifica exactamente la "expresión génica"? ¿No es la expresión génica un término general que describe todo el mecanismo por el cual el ADN se sintetiza en el fenotipo de un organismo?

probablemente con páginas SDS. Al menos asumo esto. Y comparando una página con la otra de otra parte de la planta, por ejemplo. A menudo, esto también se hace usando proteínas GFP u otras proteínas marcadas y cuantificándolas usando microscopios... haciendo westernblots o simplemente coloreando el material en puntos de tiempo definidos (lo que probablemente matará el material pero también da una idea)... es ¿Es algo como esto lo que estás preguntando? ¿Los métodos?
@TheGreenOne Sí, los métodos y las características cuantificables que usaron (digamos, fenotipos o tal vez algo relacionado con el ARNm) para medir esto. La pregunta es un poco general, lo sé.
La expresión génica implica la síntesis de ARN (o transcripción), NO la síntesis de ADN. El estudio de la síntesis de ADN generalmente se llama replicación de ADN.
Hay varias técnicas. Posible duplicado de biology.stackexchange.com/q/8153/3340

Respuestas (2)

El producto principal de los genes que codifican proteínas son los ARNm. Cuando hablamos de medir la expresión génica, queremos analizar los niveles en estado estacionario de un ARNm específico dentro de una célula. Esto generalmente se logra comenzando con una gran cantidad de células y recolectando todos los ARNm de todas las células. Una forma de medir el nivel de expresión del ARNm de un solo gen es realizar un Northern Blot. Otros métodos sensibles incluyen: un ensayo de protección de nucleasa S1, un ensayo de protección de ARNasa y un ensayo de extensión de cebador.

Los microarreglos también se han utilizado ampliamente para medir los niveles de expresión de miles de genes al mismo tiempo en un solo experimento.

Con la llegada de la metodología RNA-Seq, es posible contar el número de transcritos en un experimento (si tiene un genoma de referencia secuenciado)

Según datos de próxima generación:

Nunca trabajé directamente con ARNm, pero lo que obtuve del bioinformático fue algo así: extraes tu ARNm, lo secuencias, lo filtras según la calidad y la longitud, lo ensamblas y lo que tienes es algo así como "transcripciones". Los que está contando: xy de transcript1 & yx de transcript2. Está buscando más isoformas y, al final, está corrigiendo estos recuentos de acuerdo con las lecturas iniciales que calculó. Al comparar las transcripciones con un control, puede medir si está regulado hacia arriba o hacia abajo (estableciendo las lecturas del control como "cero", como 1234 lecturas de una transcripción son normales... en la muestra 2 tiene 5000 lecturas de esta transcripción... . el gen parece estar regulado al alza). Por lo que sé, es aproximadamente la forma en que se realizan las aproximaciones/cuantificaciones de la expresión génica.

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