ATP para el desmontaje de la relación de nucleótidos

La ADN helicasa, la enzima responsable de desgarrar las hebras antes de la replicación del ADN, requiere ATP para desgarrar los nucleótidos. He hecho esta pregunta a varios profesores y no me han podido dar una respuesta clara. Mi pregunta: ¿Cuál es la proporción de rotura de enlace ATP:nucleótido? En otras palabras, cuántos enlaces de nucleótidos se pueden romper de un solo ATP a través de la helicasa.

Este documento debería interesarle, aunque es probable que varíe entre diferentes helicasas.
Creo que el requisito de ATP también depende de la disposición del oligonucleótido que significa unión entre A y T (u) o G y C, y podría calcularse, pero todavía no puedo decir cómo.
Todo lo que hace la helicasa es abrir la doble hélice del ADN al interrumpir los enlaces de hidrógeno entre los nucleótidos. El enlace en los enlaces de hidrógeno es un nombre inapropiado, ya que es una interacción de van der Waals y no un enlace entre átomos, por lo que no se rompen enlaces, lo que requeriría mucha más energía para romper que romper los enlaces de H. Las topoisomerasas, por otro lado, necesitan catalizar roturas en el esqueleto de fosfato para aliviar la tensión del superenrollamiento. Esto no quiere decir que el ATP no se consuma, solo que los enlaces no se rompen en el proceso como usted indica.

Respuestas (1)

La respuesta a esto quizás no sea tan simple como podría pensar, en parte porque hay muchas helicasas diferentes en el cuerpo humano. También hay alguna actividad pasiva de una helicasa que no requiere ATP.

No está claro exactamente si el ATP solo está involucrado en la translocación de la helicasa o en el desenrollado real.

Para una helicasa RecQ en E. coli , un estudio encontró que "El acoplamiento mecanoquímico estrecho determinado de 1,1 ± 0,2 ATP consumido por nucleótido viajado indica un mecanismo de tipo gusano". Para más información ver Sarlós et al. (2012) .

Otro estudio ( Donmez y Patel, 2008 ) señala que "en comparación con las helicasas sin forma de anillo como PcrA (Dillingham et al, 2000) y UvrD (Tomko et al, 2007) que se mueven en promedio 1 nt por cada ATP hidrolizada, la helicasa T7 en forma de anillo es tres veces más eficiente en combustible". Esto muestra cómo puede haber bastante variación.

En pocas palabras: puede contar con los dedos la cantidad de nucleótidos desenrollados por una helicasa por ATP.

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