¿ARN pequeño no codificante (ARNs) versus micro ARN (miARN)?

¿Cuáles son las diferencias entre los micro ARN (miARN) y los pequeños ARN no codificantes (ARNs)? ¿Se usan estos dos términos indistintamente?

Respuestas (2)

Los ARN pequeños no codificantes generalmente NO se abrevian como sRNA sino como sncRNA, en todo caso. Digo "si acaso" porque la parte "pequeña" es subjetiva y solo un descriptor de acrónimo. La respuesta directa a su pregunta es, como ha escrito Forest: los miARN son un tipo específico de ARN pequeño no codificante, algunos de los cuales parecen funcionar en la regulación de la expresión génica; otros quedan por caracterizar. Otro problema con el epíteto "pequeño" es que los miARN pueden tener solo 20 nt de longitud, pero se forman a partir de pre-miARN de hasta 1000 nt.

Otras categorías de pequeños ARN no codificantes incluyen:

tRNA (transfer RNA) - originalmente abreviado sRNA (por soluble RNA) - involucrado en la biosíntesis de proteínas.

5S rRNA - un componente del ribosoma

7SL RNA: un componente de la partícula de reconocimiento de señales implicada en el reconocimiento del péptido señal de las proteínas secretadas y de membrana.

snoRNA (ARN nucleolar pequeño), muchos de los cuales actúan como ARN guía en la modificación del ARN ribosómico.

snRNA (ARN nuclear pequeño), muchos de los cuales están involucrados en el empalme, el complejo de ribonucleoproteínas que elimina los intrones del ARNm precursor (estos tienen nombres como U1, U6, etc.)

ARN SINE: ARN transcrito a partir de repeticiones nucleares intercaladas cortas (SINE - secuencias Alu en humanos) que se cree que son pseudogenes de partículas de reconocimiento de señales 7SL.

Y, sin duda, hay algunos que yo (y la ciencia) hemos pasado por alto.

Tal vez no en general, pero he visto algunos artículos en los que el ARN pequeño no codificante se abrevia como ARNs.
No hay duda. Pero no es estándar, y no debe alentarse.
@David small-RNAs es un término de uso común y hoy en día se está volviendo más o menos estándar, pero la abreviatura como "sRNA" probablemente no lo sea (en contraste con lncRNA). En general, "sin codificación" no se incluye en estas referencias. Entonces, cuando se usa sRNA, significaría un pequeño ARN no codificante (casi nunca se usa sncRNA). En cualquier caso, la definición de un ARN pequeño no codificante también es bastante imprecisa; ARN <200 nt. Hay muchas otras inconsistencias también. A partir de ahora, miARN en sí mismo es un término claramente definido y cualquier clasificación solo causaría confusión.

Los miARN son un miembro de la pequeña familia de ARN no codificante.

"Pequeño no codificante" es un término bastante amplio que abarca microARN y ARN de interferencia corto, entre otras especies de ARN regulador. La palabra clave es 'regulatorio'; cada tipo de ARN pequeño no codificante funciona mediante la unión de secuencias complementarias para ejercer algún tipo de control regulador sobre la expresión génica. Alguien con más conocimientos podría corregir o agregar a esto, pero creo que una diferencia clave entre los diversos tipos de ARN regulador depende de qué otros factores reclutan para su sitio de acción.

Las diferencias estructurales entre estos ARN son un poco más difíciles de caracterizar. Este artículo , por ejemplo, analiza cómo se ha descubierto que los miARN desempeñan funciones contradictorias en la regulación génica; reprimiendo algunos genes, regulando otros. Los mecanismos precisos detrás de esto son un tema activo de investigación, pero mucho parece depender, como mencioné anteriormente, de qué otras proteínas reclutan y esto, a su vez, parece estar influenciado por cosas como el tipo de célula y la etapa de desarrollo, entre otros. . Aquí hay otro artículo , que analiza algunas de las características estructurales basadas en secuencias de miARN. Sé que este es gratis, pero el primero podría estar detrás de un muro de pago. Si es así, póngase en contacto conmigo y puedo enviarle un pdf.

Sin embargo, no escucho que los términos se usen indistintamente, al menos no en el sentido de que alguien diga "ARN pequeño no codificante" cuando se habla específicamente de miARN.

Entonces , ¿ sRNApuede incluir miRNA, pero no al revés?
@becko Así es.