Como se menciona en los comentarios de Roland, este término no es común y lo usaron por primera vez los autores del artículo mencionado (también el paquete mencionado por Roland en los comentarios - STING).

Desde este enlace puede encontrar la definición del último átomo pesado, que es posiblemente el átomo no hidrógeno (N, C, O, S) más distal en la cadena lateral de aminoácidos.

$$\begin{array}{|c|c|c|c|} \hline Ala\ :\ C_\beta & Asp\ :\ O_{\delta^2} &Trp\ :\ C_{\eta^2} &Asn\ :\ N_{\delta^2} \\ \hline Lys\ :\ N_\zeta & Glu\ :\ O_{\epsilon^2} & Ser\ :\ O_\gamma & Gln\ :\ N_{\epsilon^2} \\ \hline Cys\ :\ S_\gamma & His\ :\ N_{\epsilon^2} & Tyr\ :\ O_\eta & Val\ :\ C_{\gamma^2} \\ \hline Gly\ :\ C_\alpha & Leu\ :\ C_{\delta^2} & Met\ :\ C_\epsilon & Ile\ :\ C_{\delta^1} \\ \hline Arg\ :\ N_{\eta^2} & Phe\ :\ C_\zeta & Pro\ :\ C_\delta & Thr\ :\ C_{\gamma^2} \\ \hline \end{array}$$

Han mencionado en el mismo enlace que:

Si en cualquiera de los archivos PDB (para ser analizados por los componentes BLUE STAR STING) falta ese átomo específico (LHA) en el registro, entonces nuestros algoritmos buscarán el próximo átomo más cercano en la cadena lateral que sería considerado como el LHA.

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La ubicación exacta de algunos de los átomos antes mencionados.

Algunas de las ubicaciones pueden ser confusas. Así que solo estoy indicando cuáles son, para algunos, los aminoácidos (especialmente para las cadenas laterales ramificadas y cíclicas).
_{[ Imágenes reproducidas de aquí .]}

Arginina

Los nitrogenos terminales$\eta^1$y$\eta^2$son simétricos y el átomo que es en realidad (estereoquímicamente) el más distal se considera el LHA, como se infiere de la estructura de la proteína. La segunda opción, obviamente, es la$\eta^1$-Nitrógeno.

Ácido aspártico

Los dos oxígenos terminales ($\delta^1$y$\delta^2$) en la forma ionizada son equivalentes (también debido a la resonancia). El átomo distal real se etiquetaría como$\delta^2$

puedes extrapolar lo mismo para el ácido glutámico

histidina

$\epsilon^2$se refiere al nitrógeno pirólico. .

leucina

Los últimos carbonos ($\delta^1$y$\delta^2$) son equivalentes y la elección se basa en la distancia real. Extrapolar para valina

Fenilalanina

$\zeta$se refiere al carbono en la posición para del anillo de benceno. Para la tirosina, el LHA es el oxígeno del para -OH en el anillo de benceno.

triptófano

prolina

Para la aspargina y la glutamina , el LHA es el nitrógeno amídico de la cadena lateral.