¿Se pueden utilizar los nanodiscos para estudiar la energía de las membranas?

Los nanodiscos han cambiado la forma en que podemos estudiar las estructuras, la inserción y las funciones de las proteínas transmembrana. A continuación se muestra una imagen de una bicapa de nanodisco.

La diferencia clave, por lo que sé, con respecto a los estudios de liposomas tradicionales es que uno puede alterar la composición de lípidos más fácilmente.

¿Se han realizado estudios sobre la cuantificación de la energía en estos nanodiscos, es decir, la transferencia de energía tras la inserción, o la estabilidad de la proteína en el nanodisco, etc. ?

¿Tienes referencias de estos? ¿Qué péptidos están usando para envolver ese disco?
Los péptidos son "una hélice α ideal", sea lo que sea que eso signifique... Encontré esta bibliografía en mi búsqueda que también parece tener algunos artículos sobre biofísica de proteínas en este sistema. Quizás uno de ellos explique más sobre la anatomía de un Nanodisc.

Respuestas (1)

Los nanodiscos son una tecnología muy poderosa para la proteína de membrana inventada en el laboratorio de Stephen Sligar en la Universidad de Illinois. Un nanodisco se compone de una proteína de membrana, lípidos y dos monómeros de una "proteína de andamio". La proteína de andamiaje más utilizada es un truncamiento N-terminal de la apolipoproteína A-1 (apoA-1), que es el componente proteico primario de las partículas de lipoproteína de alta densidad (HDL). Pero debido a que el tamaño de la proteína de estructura define el tamaño del nanodisco, las proteínas de membrana con diferentes tamaños podrían requerir diferentes tipos de proteínas de estructura.

La reconstitución de una proteína de membrana en un disco lipídico es un proceso autoensamblado. La reacción consiste en mezclar la proteína de membrana solubilizada en detergente con lípidos (que se pueden elegir según la proteína) y la proteína de andamio. La eliminación del detergente (utilizando, por ejemplo, Bio-Beads™ SM-2 Resin) inicia el proceso de autoensamblaje y se crean los nanodiscos.

Los nanodiscos proporcionan un entorno en el que las proteínas de membrana son estables y compatibles con entornos acuosos en una bicapa de fosfolípidos de tipo nativo. El entorno acuoso hace que las proteínas de membrana sean compatibles con métodos analíticos que se han limitado principalmente a investigar proteínas solubles. El entorno lipídico, que puede elegirse y optimizarse, mantiene la proteína de membrana estable, monodispersa y activa. También se puede controlar la estequiometría de la proteína. En comparación con los nanodiscos, los liposomas son grandes, inestables y difíciles de preparar con un tamaño y una estequiometría controlados con precisión.

Varias proteínas de membrana ahora se han reconstituido en nanodiscos y se han utilizado para diferentes tipos de estudios, por ejemplo, para estudiar las afinidades y la cinética de los ligandos, para RMN, para estudiar el estado de asociación de proteínas, las propiedades de señalización y los canales iónicos ( http://molsense.com/ application/trubind-at-work/ion-channel-inhibitors/ ).

http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0014579309007960

Una base muy completa de los nanodiscos. Tal vez podría ampliar o proporcionar una referencia a los experimentos de cinética. No tengo claro si estás hablando de la cinética del ligando o de la cinética de la bicapa de proteína.
Estos son algunos ejemplos: estudiar la cinética de la unión del ligando a la proteína de membrana ( ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25935416 , ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18616345 ), estudiar las interacciones proteína-proteína ( ncbi.nlm. nih.gov/pubmed/20804721 ) y estudiando las interacciones proteína-lípido ( medx.mech.northwestern.edu/publications/papers/197.pdf ). Creo que los nanodiscos son una técnica realmente poderosa y, como prueba, ¡hay muchas publicaciones realmente interesantes!