¿Qué información transmiten las imágenes de microarrays?

Bien, he leído que una célula genera 4 tipos de datos digitales (para ser precisos y discretos), a saber, ADN, ARN, proteínas (secuencias que pueden codificarse como cadenas de secuencias de nucleótidos/aminoácidos) e imagen de micromatrices. No soy biólogo, pero mi interés está en la estadística y la teoría de la información de estos datos. Me gustaría saber qué información transmite la imagen de micro matriz de ADN. Por ejemplo, después de procesarlo con la ayuda de un software adecuado, ¿qué tipo de información obtenemos?

Imagen de micromatriz de muestra:

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En el caso general, el color simplemente indica la cantidad de un ARN o ADN específico que hay en su muestra. Lo que obtenga de esto depende en gran medida del experimento exacto que esté realizando.
¿Dónde puedo obtener más información? ¿Cuál es la relación de la imagen de micro matriz con la expresión génica?
en.m.wikipedia.org/wiki/DNA_microarray En el contexto de un experimento de nivel de expresión, cada punto representa una sonda de oligonucleótido única. La intensidad de color relativa de cada punto indica la abundancia relativa de ARN en la célula que se hibrida con esa sonda.
El color se debe a una etiqueta fluorescente (Cy3/Cy5) adherida al ADN que hibrida con la matriz.

Respuestas (1)

Cada punto se superpone con una sonda de oligonucleótidos , que está diseñada para identificar una secuencia de ácido nucleico específica. Las matrices de expresión génica tienen sondas que son complementarias a las secuencias derivadas de los exones; por lo tanto, se hibridarán con estas secuencias.

Antes de la hibridación, el cDNA (en este caso) se marca con una molécula fluorescente como Cy3 o Cy5 (se pueden usar dos colorantes para diferenciar el tratamiento y el control). Tenga en cuenta que cada punto tendrá muchas moléculas de sonda. La intensidad fluorescente es proporcional al número de cadenas de ADN hibridadas, que a su vez es proporcional a su expresión en la muestra.

Hay disponible una gran cantidad de textos sobre el análisis de datos de micromatrices que puede encontrar con bastante facilidad.

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