Proteína transmembrana: ¿el péptido señal siempre forma un bucle?

Así que he leído un par de veces que

b. SP probablemente forma un bucle, no una flecha. El bucle entra en el canal (translocón) en la membrana. El bucle SP es probablemente lo que abre (puertas) el canal en el lado citoplásmico.

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Y me preguntaba por qué sería así. Me parece mucho más complicado que la proteína gire alrededor que que el péptido señal simplemente se incruste en el poro del translocador y el resto de la cadena polipeptídica se sintetice en el lado citoplásmico.

Entonces, si la proteína estaba destinada a pasar a través de la membrana nuevamente, habría otra secuencia de señal de transferencia de inicio (por lo que las dos primeras secuencias de señal serían dos secuencias de transferencia de inicio en lugar de una transferencia de inicio y una transferencia de parada).

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Creo que tal vez una imagen podría ayudar, también vea algunas notas de clase aquí , de donde saqué las imágenes: en resumen, si tiene una cadena intacta, no puede pasarla por un agujero excepto como un bucle a menos que comience en el muy final, y a menudo no quieres hacer eso.

Las secuencias señal pueden estar en cualquier parte de la proteína. Esa porción es la parte del péptido que se une al poro translocador en la membrana. Esa porción tiene que permanecer unida para que el proceso continúe: no es posible simplemente "alimentar" el polipéptido en crecimiento sin asegurarlo de alguna manera, y eso es precisamente lo que hace la secuencia señal al interactuar con el translocón.

Síntesis de proteínas de membrana http://web.uconn.edu/mcb380/fig12-45a.GIF http://web.uconn.edu/mcb380/fig12-45b.GIFSíntesis de proteínas de membrana 2

Este proceso también permite todo tipo de arreglos: enviar la proteína completa, o solo el extremo N o C, o tener múltiples secuencias de señal para crear múltiples dominios transmembrana. Especialmente en el último caso, realmente no hay otra forma de hacerlo, excepto formando un bucle en algún lugar, a menos que realmente ligara polipéptidos separados, lo que sería bastante complicado y difícil y requeriría enzimas especializadas adicionales: mucho más complicado que un bucle agradable y ordenado.

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