¿Por qué este antisuero específico de la cepa viral no logra inmunoprecipitar lo mismo (98 % de proteína idéntica) de otra cepa?

Estoy leyendo este documento https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC392475/ y no puedo entender por qué cierto suero inmunológico no funcionó en la misma proteína viral pero de diferentes presiones.

El suero se extrajo de animales portadores de tumores infectados con la cepa 'SR' del virus del sarcoma de Rous y luego se usó para inmunoprecipitar la proteína viral p60-src de las células infectadas con el virus. Las células en cuestión habían sido infectadas con SR u otras cepas estrechamente relacionadas, todas las cepas expresan la misma proteína. Pero el antisuero solo extrajo el p60-src de la cepa SR y no la misma proteína de otras cepas. Pensé que podría deberse a que el suero se había dirigido por casualidad a un epítopo específico de la cepa SR, por lo que se produce una gran proliferación de células B complementarias a este epítopo, lo que eclipsa la detección de otros epítopos. Pero 1. Creo que el suero se tomó de varios conejos y seguramente no todos habrían hecho esto. y 2. un artículo posterior que leí decía que p60-src es 98% igual en SR, Pr, Br, etc., por lo que parece poco probable que se haya enganchado a un bit específico de SR. Y, sin embargo, los autores afirman que, debido a las similitudes entre los genes SRC, "... productos génicos similares probablemente estén presentes en células transformadas por otras cepas de ASV, pero no se detectan debido a la falta de reacción cruzada con los antisueros actualmente disponibles. "

Entonces mi pregunta es, ¿qué está causando esta falta de reacción cruzada? Disculpas si la respuesta es muy obvia, soy nuevo en el tema y actualmente tengo muy poco conocimiento de métodos experimentales. Gracias de antemano por cualquier información o corrección sobre las conclusiones que he sacado hasta ahora, ya que también podrían ser inexactas.

Nota: gracias mods por dejarme editar la pregunta para mejorar la privacidad.

No elimine las preguntas votadas a favor con una respuesta aceptada. Si hay un problema fundamental con la publicación, marque la pregunta para llamar la atención del moderador o publique una pregunta sobre ella en meta. Gracias.
Si le preocupa el software de plagio, utilice la función de edición de manera significativa para cambiar la pregunta.

Respuestas (1)

Como observa, las cepas virales no son idénticas; No está claro a partir de su pregunta la cantidad real y la posición de las diferencias de aminoácidos entre ellos, pero no es sorprendente que incluso una parte de la proteína tenga un epítopo inmunodominante y, por lo tanto, impulse la especificidad de cepa reproducible de cualquier suero inmunológico producido.

Recuerde que los conejos u otros animales utilizados para producir anticuerpos suelen ser, al menos, cepas endogámicas criadas para uso en laboratorio y, por lo tanto, es probable que tengan menos diversidad genética entre los individuos de lo que cabría esperar.

Otro artículo de este período informa que diferentes sueros inmunes generados a partir de cepas de virus relacionadas y producidos en diferentes animales variaron desde la inmunoprecipitación de la proteína viral src en cero de las cepas virales probadas hasta la inmunoprecipitación de la proteína en todas las cepas virales probadas: "Detección de la Producto del gen del sarcoma viral en células infectadas con varias cepas del virus del sarcoma aviar ..." Brugge et al (1979) Journal of Virology Vol 29 No 3 p 1196-1203

Pueden ser; también podrían no serlo. Creo que, en general, esperaría ver menos variabilidad en la respuesta inmune (no necesariamente en el rango de objetivos) entre los animales de laboratorio. Sin embargo, los sueros inmunitarios generados naturalmente son bastante complejos y deben caracterizarse individualmente una vez que se generan. Recuerde también que el artículo que está leyendo es de hace más de 40 años, antes de la PCR, antes de la secuenciación sencilla del ADN, antes de la mayoría de la bioinformática, antes de la mayor parte de la comprensión de los oncogenes, etc.