Entonces la pregunta es si:
una eliminación de un codón para el aminoácido lisina (AAG) es más o menos probable que cause la no funcionalidad de la proteína que:
Inserción de una base adicional (C) dentro del codón de inicio para esta proteína
Mutación del codón de parada (TAG) a un codón de arginina (CGC)
Mi intento de respuesta:
No es más probable. Dado que la inserción de la base "C" se realiza desde el principio, el marco de lectura podría cambiarse y la secuencia permanecería igual después de la primera base. Dado que el codón de inicio más común es "ATG", la "C" no lo afectaría y la "lectura" de la secuencia comenzaría después de la "C" y en "ATG".
Más grave que el codón de parada es lo que indica que la traducción de la secuencia ha terminado, por lo que si el codón de parada se modificara, la secuencia continuaría en la región no traducida. Se agregarían más péptidos a la secuencia que solo se detendría cuando se alcance el siguiente codón de parada. Si el siguiente codón de parada está relativamente cerca y la longitud es similar a la de una proteína normal, entonces todavía estaría funcionando. Pero en la mayoría de los casos, continuaría durante un tiempo considerable y haría que no funcionara.
Creo que la pregunta está redactada de manera bastante confusa, así que buen trabajo en su intento basado en eso.
Si se inserta una C dentro del codón de inicio, supongo que se refiere a hacer una secuencia que originalmente era ATGXXX y convertirla en ACTGXXX o ATCGXXX. Cualquier inserción significa que el codón de inicio faltará por completo. Esto hará que no se produzca ninguna proteína en absoluto, o que el comienzo de la proteína se trunque gravemente o se desplace por completo si se crea otro marco de lectura abierto aguas abajo. Esto va a ser magnitudes más graves que una deleción de 3 bases correspondientes a una lisina.
Creo que su respuesta aquí está bien: pueden pasar muchas cosas si falta un codón de parada. Si sucede que hay otro codón de parada en el mismo marco de lectura poco después, entonces el efecto podría no ser tan severo, pero si no, podría resultar en una cadena peptídica adicional sustancial agregada al final de la proteína, lo que podría causar todo tipo de problemas con el plegamiento, y es posible que el ARNm ni siquiera sea funcional y se degrade.
Una vez más, esta pregunta no está redactada de la mejor manera, pero creo que el principio general que intenta transmitir es que los codones completos que faltan dañan mucho menos la estructura de una proteína que las mutaciones que afectan el marco de lectura o la parada. /codones de inicio, porque afectan a un único aminoácido . Por supuesto, podría resultar que ese aminoácido sea crucial para la estructura de la proteína, pero la pregunta es qué es lo más "probable".
Yo interpretaría "dentro del codón de inicio" en el sentido de cambiar ATG a ACTG o ATCG o ATGC. Todo lo cual va a destruir el codón de inicio, lo que probablemente arruine la proteína.
Mientras que agregar aminoácidos adicionales al final podría no afectar la función proteica del resto de la proteína. Las funciones de las proteínas tienden a basarse en dominios, y agregar más aminoácidos al final podría no alterar la estructura y, por lo tanto, la función de los dominios que pertenecen a la proteína.
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