Justo antes del Día D, ¿cómo se limpiaban las minas navales en secreto?

Parece que el artículo wiki que vinculaste lo cubre bastante bien:

El bombardeo de Normandía comenzó alrededor de la medianoche con más de 2200 bombarderos británicos, canadienses y estadounidenses atacando objetivos a lo largo de la costa y más hacia el interior.

y entonces:

Los dragaminas comenzaron a despejar los canales para la flota de invasión poco después de la medianoche y terminaron justo después del amanecer sin encontrarse con el enemigo.

(todo el énfasis es mío) No fue exactamente una misión sigilosa. El bombardeo comenzó y proporcionó fuego de cobertura para permitir que los dragaminas se acercaran.

Una discusión interesante del proceso de uno de los individuos involucrados se puede encontrar aquí :

Nuestro barco, que estaba en el lado de babor lanzando boyas, tenía el trabajo de dar un toque fuerte de sirena cada vez que se lanzaba una boya, para que la capa de boyas en el lado derecho dejara caer su boya en el mismo momento. El espantoso sonido de la sirena nos hizo preguntarnos si los alemanes no nos escucharían llegar, pero no pasó nada. Nuestras propias fuerzas costeras ligeras estaban en plena marcha, esperando para darnos cobertura en caso de que fuéramos atacados.

Entonces, no es un proceso silencioso, o secreto de ninguna manera.

El proceso de barrido de minas de la época implicaba soltar las minas y luego detonarlas en la superficie con disparos. Pero nuevamente, el bombardeo que se estaba realizando podría cubrir cualquier detonación. (Imagen de wikipedia )

Entonces, entre la detonación de minas, el sonido de las sirenas y los bombarderos aéreos que atacan la costa, no creo que esperaran secretos en este momento.

El mar es grande y los alemanes estaban muy dispersos defendiendo miles de kilómetros de costa desde Noruega hasta el sur de Francia.

Con la supremacía naval y aérea aliada, no tendrían barcos ni aviones monitoreando regularmente el campo minado. El radar de superficie alemán era de corto alcance. Y el mar de noche es muy, muy oscuro, incluso con luna llena.

La acción aérea y naval aliada se mantuvo a lo largo de la costa como parte de una operación para confundir a los alemanes cuando llegara la verdadera invasión. Cuando llegó el 5 de junio, los alemanes no pensaron que fuera raro ser bombardeados, ni les parecería raro encontrar pequeños barcos aliados cerca de la costa. Incluso los informes de los paracaidistas no dieron la alarma de invasión.

p.434 #2 EN 6, Párrafo 16 . Durante la fase de asalto, todos los barrenderos disponibles estarían comprometidos con la barrera de minas o dentro del área de asalto. El riesgo no era grande ya que el canal costero británico normalmente se registraba constantemente, no se creía que el área al norte de la barrera tuviera minas y se registró durante las semanas anteriores a NEPTUNE solo para asegurarse.

El mapa de la pregunta muestra la disposición de las fuerzas navales aliadas después de perforar el campo minado. El "Límite Norte del Área de Asalto" es 49N 40'. El campo minado estaba significativamente más lejos, desde 50N hasta 49N 50'. Más adentro, la navegación costera alemana y francesa se vería amenazada.

En ON6, [el almirante] Ramsay dio órdenes para superar los campos de minas alemanes, y especialmente la barrera que se sabe que se colocó desde aproximadamente la latitud 50ºN hasta entre siete y diez millas de la costa de Normandía. Aunque al sur de la misma se extendía un canal costero dejado libre por el enemigo para su propio uso, y con el que contaba el plan 'Neptuno' para el despliegue final de las fuerzas de asalto y bombardeo, incluso éste podría ser minado en el último momento.

Fuente

Para evitar alertar a los alemanes, los dragaminas tuvieron cuidado de permanecer justo en frente de la fuerza de invasión y no barrer todo el camino hasta la costa.

54. Para evitar que el enemigo se enterara del acercamiento de los Aliados, o del área a la que se dirigía el Asalto, hasta el último momento posible, era esencial que los dragaminas cortabarreras no operaran demasiado lejos en la vanguardia de los principales barcos de asalto. La velocidad máxima de la embarcación líder en algunos canales era de 5 nudos, la velocidad mínima segura de barrido de minas era de 7½ nudos. Por lo tanto, los dragaminas debían perder aproximadamente una hora y media. Lo lograron retrocediendo durante 40 minutos justo antes de estar dentro del alcance del radar enemigo. Hacer dos giros de 180° con barridos fluyó fue una maniobra difícil, complicada aún más por la marea.

55. ... El enemigo no fue alertado por los barrenderos que se acercaban, aunque la 14.ª flotilla de barrido de minas, que operaba la ruta del convoy lateral de Force U, y en el primer canal de aproximación, estaba a la vista de la costa francesa desde la tarde del D menos 1.

56. Las aguas costeras, que se encuentran entre el área de transporte y las playas de asalto, no fueron barridas durante los ataques iniciales.

Fuente: Historia administrativa naval de los Estados Unidos de la Segunda Guerra Mundial, Capítulo VII - Medidas defensivas - Operación Neptune, Parte V - Operaciones de barrido de minas Neptune