(Genética) ¿Es lo mismo silenciador que silenciamiento génico (heterocromatina)?

¿Es lo mismo silenciador que silenciamiento de genes? Sé que el silenciamiento de genes se refiere a la heterocromatina concentrada en los telómeros o centrómeros. También está relacionado con la metilación. Pero ¿qué pasa con un silenciador? ¿Son lo mismo? ¿O silenciador es lo opuesto a potenciador (represor)?

Respuestas (1)

Estás un poco confundido con tus términos aquí. Recuerde, cuando habla de la regulación natural de un transcriptoma, puede controlarlo a nivel del genoma, el transcriptoma y el epigenoma.

La proteína represora es una proteína de unión a ADN o ARN que inhibe la expresión de uno o más genes al unirse al operador oa los silenciadores asociados. Dependiendo de dónde se una, regula a nivel del genoma o del transcriptoma.

La Región Silenciadora de Genes , es una secuencia de ADN en el genoma que permite que las proteínas represoras se unan a él. Suele estar muy cerca del promotor del gen que quiere controlar. Esto controla la expresión del gen a nivel del genoma para reprimir la transcripción del gen. Existen algunos tipos (silenciadores Classc, reguladores negativos y respuesta Polycomb) pero no entremos en eso).

Un ejemplo es el elemento regulador en el operón Lac clásico.

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El silenciamiento de genes , como usted lo llama, es de naturaleza epigenética. Te indicaré el wiki, ya que es bastante grande y diverso para explicarlo aquí: http://en.wikipedia.org/wiki/Gene_silencing

puede leer más sobre esto aquí: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK26872/

Nunca he oído hablar de NRE; ¿qué es? ¿Es el elemento de respuesta PRE Polycomb? o está regulada negativamente y regulada positivamente. Por favor, expanda las abreviaturas. Además, el operón lac no es un ejemplo de "silenciador". Es solo un caso de simple represión transcripcional. Los silenciadores, como los potenciadores, operan a larga distancia y tienen efectos más globales, pero funcionan de forma opuesta a los potenciadores, es decir, reducen la actividad transcripcional.
@WYSIWYG ¿El operón Lac no contiene un elemento regulador que lo mantiene apagado normalmente (LacI)? También edité la publicación de las siglas.
Sí, tiene un elemento regulador en el promotor que está unido por LacI. Estos son elementos cis habituales y con frecuencia se denominan operadores; sólo afectan al gen proximal. Los potenciadores y silenciadores controlan una sección más grande de cromatina que puede incluir muchos genes y, a veces, también interactúan con promotores a través de bucles de ADN.
@WYSIWYG Interesante. Nunca escuché que se le llamara operador antes (nunca se enseñó de esa manera), pero ese es un término. Cuando dice que los potenciadores y los silenciadores controlan una sección más grande de la cromatina, asumo que está diciendo que los potenciadores no son específicos del gen, ¿verdad (en cuyo caso lo entiendo)? ¿O está diciendo que los potenciadores y los silenciadores también controlan las estructuras secundarias de la cromatina (realmente no he buscado esto)?
Los potenciadores y silenciadores regulan varios genes y pueden interactuar con sus promotores, causar cambios epigenéticos o ambos. Ambos procesos conducen a un cambio en la estructura de la cromatina.
@WYSIWYG Gracias por la aclaración. ¿Tiene una referencia para potenciadores/silenciadores que alteran la epigenética? Me gustaría mucho leer sobre eso. Sé que la epigenética puede cubrir o descubrir potenciadores, pero no he oído que se haga al revés.
Muchos elementos receptivos de Polycomb/Trithorax actúan como potenciadores (así es como llegué a conocerlos inicialmente). Otros ejemplos incluyen CTCF, CEBP, etc. Puede encontrar muchas buenas críticas sobre estas proteínas.
CEBP no media modificaciones epigenéticas pero los otros que mencioné, sí.