He estado investigando genética y bioquímica en mi tiempo libre y he notado que proteínas como la albúmina y las apolipoproteínas que facilitan el transporte extracelular y proteínas como GLUT1 que transporta la glucosa a través de la membrana celular o MFSD12 que transporta la cisteína a los melanosomas de los melanocitos. se denominan "proteínas de transporte" o "proteínas transportadoras". Tal vez sea solo mi opinión como profano, pero por lo que puedo decir, estos son dos procesos claramente diferentes, no veo la lógica en referirme a estos con el mismo nombre. Una es una proteína unida a una membrana que facilita la difusión a través de esa membrana y la otra es una proteína que pasa la mayor parte de su vida transportando moléculas fuera del dominio de cualquier célula.
Me pregunto si tal vez hay un conjunto de terminología que distingue entre los dos.
La respuesta corta a esta pregunta es NO.
Para entender la razón, uno necesita apreciar ciertas cosas sobre las proteínas y sobre la investigación en ellas. Un objetivo principal en la investigación de las proteínas es comprender cómo sus estructuras determinan su funcionamiento, no clasificarlas según su función. Por supuesto, es útil asignar proteínas similares a grupos y usar frases para describirlas, pero a medida que la ciencia avanza, es posible que las categorías generales sean inválidas o inútilmente amplias, e incluso cuando sean válidas, puede ser más útil considerar categorías más estrechas, con los profesionales. ser consciente del panorama general.
He dado conferencias introductorias sobre proteínas a estudiantes universitarios y enumeraría algunos de los diversos roles que pueden desempeñar. Podría haber dicho algo como “algunos catalizan reacciones, algunos juegan un papel estructural, algunos transportan sustancias a través de las membranas, otros transportan moléculas de un lugar a otro…”. Por razones de estilo, he usado dos verbos diferentes, "transportar" y "llevar", y si quisiera hacer encabezados para una lista, podría usar "proteínas transportadoras" y "transportadores de membrana", pero estas no son categorías oficiales y otros podrían usar otras descripciones.
Como comentó @bryankrause, las "proteínas de transporte transportadoras" como la apolipoproteína, la albúmina, los transportadores de zinc, la hemoglobina, etc. representan tipos muy diversos y, por lo general, no se consideran juntas después de la primera introducción. El término "proteína transportadora" tiene problemas, ya que puede asociarse mentalmente con "proteína transportadora de acilo".
En cuanto a los "transportadores de membrana", es instructivo mirar el índice del texto respetado, Berg et al . Bioquímica — Capítulo 13 que considera tales proteínas bajo el título “Canales de membrana y bombas”. Esto tiene un subtítulo "Muchas moléculas requieren transportadores de proteínas para cruzar las membranas", pero luego procede a usar términos específicos para diferentes clases como "proteínas de canales de iones", "transportadores secundarios", "bombas de iones".
En conclusión, los investigadores de proteínas tienden a centrarse principalmente en frases descriptivas y subcategorías especializadas precisas cuando hablan de grupos funcionales. Lo más parecido a la taxonomía biológica son quizás las clasificaciones estructurales como SCOPe .