¿Es posible secuenciar solo el componente 16S rRNA? ¿Si es así, cómo?

Recientemente ha habido varios artículos sobre el uso de 16S rRNA como una forma de identificar especies ( aquí y aquí ). Me pregunto si es posible secuenciar solo esa subunidad del ribosoma o solo la secuencia de ADN de la que proviene (probablemente no, lo sé). De esa manera, puede usar solo la secuencia que necesita para compararla con otras secuencias de ARNr 16S para probar especies nuevas.

Si es así, ¿cuál es el proceso involucrado?

Tal vez solo estoy leyendo demasiado su pregunta, pero ¿por qué pensaría que la secuenciación de 16S sería más complicada que la secuenciación de cualquier otro gen?
Bueno, creo que la respuesta simple es sí y, de hecho, se hace comúnmente.
@nico & bobthejoe bueno, no estoy familiarizado con el proceso de secuenciación de genes, así que no tengo ni idea de cómo se hace. ¿Podrías explicar el proceso? Editaré la pregunta.
probablemente debería leer sobre la PCR de colonias. ese es el metodo mas simple...

Respuestas (1)

Básicamente, todos los genes 16S están muy conservados, es decir, comparten bases muy idénticas. Esto significa que uno puede unir la pieza del gen 16S (después de cortar el ADN) a otra pieza específica de ADN, incluso si no conoce exactamente las bases del gen 16S. Todo lo demás se descarta entonces. Ahora por fin, mediante PCR se amplifica y secuencia el resto. Secuenciar solo 16S es mucho menos trabajo, así es como lo hicieron hace años. Hoy en día, los microbiomas completos son secuenciados por laboratorios profesionales.

¿Es posible observar la molécula de ARNr real y obtener la secuencia de ARNr en lugar de secuenciar el ADN que la codifica?
No sé, pero creo que sería una buena pregunta. 8)
¿Es posible secuenciar solo el componente 16S rRNA? ¿Si es así, cómo?
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