Soy estudiante de ingeniería informática y tengo un proyecto sobre bioinformática. De esta manera, necesito encontrar confianza en la predicción (o asociación, no estoy seguro de la terminología correcta) de las relaciones de enfermedad de miARN. Permítanme aclarar mi pregunta con un ejemplo. Por ejemplo, en una de las bases de datos relacionadas con la bioinformática (HMDD) se dice que el miARN X está relacionado con la enfermedad Y. Quiero saber cuál es la confianza. Quiero decir, ¿estás 100% seguro de tal relación? ¿Conoces alguna base de datos para ese propósito? En HMDD solo puedo encontrar miRNA: parejas de nombres de enfermedades, no proporciona ninguna estadística.
Puedes comenzar estudiando cómo un miARN regula el funcionamiento de un gen. básicamente se une a la 3'UTR y 5'UTR de un ARNm y restringe su traducción. Habrá genes asociados a la enfermedad de tu interés, descubre los miRNA's relacionados con esos genes. Puede usar datos de micromatrices para descubrir los genes regulados al alza. Target scan human, miRDB, son varias bases de datos para recuperar los miARN relacionados con los genes. El nivel de confianza para descubrir la asociación de ciertos miRNA con la enfermedad nunca puede ser del 100%. pero se puede establecer una relación simplemente viendo la complementariedad entre el miRNA y el mRNA expresado durante el estado de enfermedad.
Nandor Poka
pila desbordada
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