Al sintetizar hebras de ADN y comenzar a "conectarlas", ¿qué tan rápido se convierte en una hélice?
En esta respuesta , canadiense dice
La estructura helicoidal es más estable que la forma "recta" (debido a las interacciones de apilamiento de bases), por lo que se forma espontáneamente.
Esto me hace pensar en el siguiente escenario: digamos que uno está construyendo dos hebras de ADN a partir de desoxirribonucleótidos. Luego, uno comienza a conectarlos con enlaces de hidrógeno. Antes de que se agreguen los enlaces de hidrógeno, entiendo que las dos hebras serían rectas y no helicoidales (si esto es incorrecto, por favor corríjame), así que en algún momento, cuando las dos hebras están conectadas, "espontáneamente" se volverán helicoidales.
La pregunta, entonces, es en qué punto. ¿Después de una "conexión"? ¿Dos? ¿Todas las conexiones necesarias para completar la pieza de ADN?
En general , un ácido nucleico monocatenario es helicoidal en ausencia de otra estructura secundaria. El apilamiento de bases que impulsa la formación de hélices ocurre entre bases adyacentes en la misma hebra. Tenga en cuenta, sin embargo, que tales estructuras son dinámicas y dependen de propiedades como la temperatura y la concentración de sal. Puede ver un ejemplo de una hélice de ARN monocatenario en la siguiente estructura cristalina ( 1MHK ):
Tenga en cuenta que la hélice azul en la parte inferior de la imagen es en realidad un dúplex en el cristal.
canadiense
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David