¿Cuál fue el primer trabajo de biología computacional?

Otra nominación, si incluye la epidemiología de enfermedades infecciosas como parte de la biología y, por lo tanto, simulaciones computacionales de epidemias como parte de la biología computacional:

Periodicidad del sarampión y tamaño de la comunidad , MS Bartlett, J. Roy. Stat Soc. A , 120(1), 1957.

Los cálculos se realizaron en la computadora de Manchester. Posiblemente la parte más entretenida del documento es la discusión posterior de uno de los asistentes informáticos:

Sr. JC GOWER: Me gustaría describir con un poco más de detalle el programa para la computadora de Manchester que ha producido los resultados que el profesor Bartlett ha estado discutiendo... Debido al hecho de que la computadora comete errores con frecuencia y en vista de la aparente imposibilidad de obtener una verificación global... es necesario repetir los cálculos... Los números aleatorios se producen en lotes de 64. Cada lote se prueba para detectar la divergencia del número esperado de dígitos unitarios. Si la prueba falla, se produce y prueba un nuevo lote. Si fallan tres lotes sucesivos, la máquina se detiene y pita continuamente.

Solo una vez en los dieciséis meses durante los cuales el programa ha estado funcionando han fallado tres lotes sucesivos...

Pero el ganador (también en biología de poblaciones) podría ser el que está vinculado en los comentarios a una discusión de Biostars, Frecuencias de genes en una línea determinada por selección y difusión RA Fisher Biometrics 1950. En la pág. 169 dice el autor

Le debo esta tabulación al Dr. MV Wilkes y al Sr. DJ Wheeler , que operan la computadora electrónica EDSAC .

(la tabulación es la solución de la ecuación diferencial$\frac{d^2 q}{dx^2} = 4 x (1-q)q$con condiciones de contorno$q=1/2$a$x=0$y$q=0$como$x \to \infty$); la página de Wikipedia sobre las afirmaciones de EDSAC (vinculada arriba)

[El estudio de Fisher] representa el primer uso de una computadora para un problema en el campo de la biología

No creo que alguna vez encuentres el primer trabajo en bioinformática (o biología computacional, como tú dices), sin embargo, el campo realmente comenzó en la época de la acumulación de datos sobre bioquímica de proteínas. Los biólogos computacionales (antes de tener acceso a la computadora) estarían escribiendo y analizando morfologías y tipos de proteínas con lápiz y papel.

Pero puedes ir incluso más atrás que esto. La "alineación" es otra técnica antigua utilizada en bioinformática. Esto establece la cantidad de similitud entre dos secuencias de ADN, o más bien el grado de similitud entre dos objetos o conjuntos de datos en biología computacional.

Sin embargo, su pregunta solicita un artículo científico (uno de los más antiguos) sobre bioinformática. Podría decirse que este es el artículo de MO Dayhoff: "Un programa informático para ayudar a la determinación de la estructura de la proteína primaria". (1962)

Este es el primer documento formal que limita el alcance de la biología computacional a la definición proporcionada por este artículo de BioPlanet y generalmente aceptado por muchos:

La bioinformática es la aplicación de la tecnología informática a la gestión de la información biológica.

Dependiendo de su definición de biología computacional (por ejemplo, la bioinformática y el modelado matemático pueden ser bastante diferentes), hay una referencia citada con frecuencia al trabajo de Alan Turing después de la segunda guerra mundial, modelando lo que él llamó "morfógenos" en la aparición de patrones matemáticos en naturaleza. Según tengo entendido, modeló la difusión de moléculas hipotéticas antagónicas y complementarias en el espacio y el tiempo. Estoy bastante seguro de que este es uno de los primeros ejemplos del uso de las primeras computadoras, cuando aún recordaban a las máquinas contadoras para problemas biológicos.

No tengo una referencia exacta para usted en este momento, pero algunos google-fu de "Turing" y "morfógenos" arrastrarán algo.

EDITAR: aquí está el artículo, ¡1952 es el año a vencer!:

http://www.dna.caltech.edu/courses/cs191/paperscs191/turing.pdf

No tengo idea sobre el primer artículo sobre biología computacional (interpretado por mí como artículos que usan computadoras y simulaciones por computadora para resolver problemas biológicos). Sin embargo, algunos ecologistas de poblaciones fueron los primeros en adoptar simulaciones por computadora para resolver modelos de población. Debería mirar a Micheal Hassell , que sé que fue temprano en el uso de simulaciones por computadora. Uno de sus primeros artículos es Nuevo modelo inductivo de población para parásitos de insectos y su relación con el control biológico. de 1969 ( pdf ), donde los modelos se simulan en la "computadora Oxford KDF9". Sus otros papeles y sus colaboradores podrían ser un punto de partida.

Hay cierta ambigüedad en las palabras; sin embargo, la "biología computacional" se usa a menudo para enfatizar que el trabajo se extiende más allá de la información de secuencias (y las propiedades derivadas de secuencias) y la gestión de datos (que preferiría describirse como "bioinformática").

Si la pregunta es sobre el primer trabajo que usó simulaciones por computadora y algoritmos para descubrir y explicar mecánicamente algún problema biológico complejo, el trabajo de Hans Meinhardt y sus colegas se acerca mucho a una primera pieza de biología computacional.

Por ejemplo, descubrieron cómo se podían formar patrones; Gierer et Meinhadt 1972 , y otras referencias contenidas en su obituario