Me encontré con una diapositiva ppt en línea del algoritmo bioinformático donde se dice que el primer y el último ángulo de Ramachandran de aminoácidos no son necesarios para decir todas sus coordenadas internas. ¿Realmente no es necesario para ninguna simulación al predecir la estructura 3D de las proteínas? Por ejemplo, si tenemos una cadena proteica de N secuencia de aminoácidos, habrá ángulos diédricos de 2N. De los cuales necesitamos especificar solo los ángulos diédricos 2N-2 (aparte de los ángulos diédricos del primer y último aminoácido). ¿Por qué se ignoran los dos ángulos? Supongamos que se proporcionan todos los ángulos de enlace y las longitudes de enlace para toda la cadena.
He visto esta afirmación en el siguiente ppt, diapositiva número -9, titulada representación de coordenadas internas, en el punto 3.
Piensa en el caso de una cadena de N=3 puntos en el espacio. Solo hay ángulos asociados con el punto medio, los dos extremos no tienen ángulos asociados porque solo tienen un segmento incidente en lugar de dos.
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