Entiendo que surgen debido al emparejamiento de bases de dos soportes opuestos y son sitios a través de los cuales interactúan proteínas importantes necesarias para la replicación y transcripción del ADN. Pero no entiendo cómo la disposición de las bases realmente genera los surcos.
Primero el surco MAYOR. Esto se puede considerar olvidando que las dos hebras de ADN están separadas y pensando en ellas como fusionadas como una cuerda o un cable eléctrico en mi diagrama a continuación. El cable está enrollado alrededor de un eje, que se puede considerar como una varilla imaginaria. Se podría enrollar el cable apretadamente alrededor del eje para que siempre estuviera en contacto consigo mismo y sin espacios intermedios (como en el extremo izquierdo), o se puede enrollar con menos fuerza y con espacios intermedios (imágenes posteriores). Esto último es lo que sucede y el espacio que deja el enrollamiento de la cuerda es el surco mayor (porque es más ancho que el surco menor al que llegamos a continuación).
Entonces, a su pregunta, ¿qué causa que este devanado sea como es, es decir, qué causa el paso particular de la hélice del ADN? Esta es presumiblemente la conformación termodinámicamente más estable, maximizando la fuerza del enlace de hidrógeno entre las bases (más lineal, ni demasiado cerca ni demasiado lejos) y minimiza la repulsión estérica y eléctrica (el esqueleto de fosfato está cargado negativamente).
A continuación, el surco MENOR. Ahora tenemos que considerar que nuestro 'cable' es en realidad dos hebras de ADN: una columna vertebral de fosfato de azúcar con las bases emparejadas en el centro. Aunque las bases están en el centro, el espacio entre las dos cadenas de azúcar-fosfato no está completamente ocupado. Esto crea otro surco, el surco menor, menos ancho y de origen bastante diferente al surco mayor, pero aún capaz de acomodar ciertas proteínas pequeñas. Da la casualidad de que este es el caso de la analogía del cable eléctrico ilustrada. El cable son dos hilos eléctricos, pero están encerrados en el mismo aislador de plástico.
Entonces, a su pregunta, ¿qué causa el surco menor? Esta es solo la forma tridimensional de la doble cadena de ADN que refleja las moléculas que la componen. Los grandes grupos de fosfato se pueden considerar como tubos anchos a cada lado, mientras que las bases entre las hebras son planas y, por lo tanto, conducen a un surco, independientemente de si está enrollado en una hélice o (en la imaginación de uno) estirado.
(El surco 'mayor' tiene un tamaño exagerado en comparación con el surco 'menor' en la analogía del cable, pero espero que ilustre la diferencia entre los dos).
Tyto alba
canadiense
Tyto alba
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