Aquí está la tediosa pregunta del examen que pregunta esto: pregunta 8(b). https://drive.google.com/drive/folders/0B23NLD5L6099VWJya3dfLVJpbmc
La pregunta dice:
En 2007, el oso pardo era una especie amenazada en Alberta, Canadá. Se realizó un estudio para determinar el número de osos en la zona. Se recolectó piel de árboles contra los que los osos se habían frotado y se analizó su ADN.
(i) Explique cómo el análisis de ADN ayudaría a los científicos a determinar la cantidad de osos en el área.
La respuesta simplemente dice:
idea de comparar bandas
idea de que cada oso tiene {ADN / patrones de bandas} únicos
idea de que la cantidad de patrones de bandas diferentes equivaldría a la cantidad de osos diferentes
Mi pregunta es: ¿Cómo encaja todo el proceso en conjunto?
Estoy absolutamente desconcertado en cuanto a cómo encajaría toda la investigación entre sí, y he estado tratando de articularlo durante horas. Parece que si solo voy a recolectar muestras de piel de los árboles, habrá células pertenecientes a diferentes especies, entonces el patrón de ADN producido incluirá una cantidad diferente de bandas de todas las especies diferentes. Para superar este problema, pienso '¿de alguna manera separaríamos las diferentes células en diferentes grupos con cada grupo perteneciente a un oso específico mediante alguna técnica que no sea un perfil de ADN y no necesito saber sobre el nivel de la escuela secundaria? Entonces razono que habríamos logrado nuestra tarea de identificar el número de diferentes números de osos presentes dentro de la muestra. ¿Cómo se identificarían los diferentes números de osos?
La segunda parte de mi pregunta es que no entiendo cómo se usarán las diferentes muestras de árboles y pieles para estimar el tamaño total de la población dentro del área. La única técnica de muestreo de animales que conozco es el método de captura y recaptura.
El proceso general de creación de perfiles de ADN (prefiero llamarlo "huellas dactilares de ADN", pero solo soy yo) generalmente implica desarrollar cebadores de PCR específicos para una región particular que rodea algún tipo de región altamente polimórfica. Entonces, en este caso, se necesitarían cebadores que rodeen a los VNTR (u otras regiones polimórficas, eche un vistazo al artículo de wikipedia para obtener una descripción general de algunos otros métodos). Suponiendo que los cebadores de PCR sean específicos para los osos (uno podría explotarlos para tener una idea de esto), entonces, independientemente de los otros animales que se mezclaron, las bandas resultantes serían predominantemente de osos (después de todo, la PCR da como resultado una amplificación exponencial de especies preferidas). Esta sería la parte de respuesta (1).
Para la parte 2, es necesario encontrar un número suficiente de regiones suficientemente variables para que funcione el perfilado. Un solo sitio puede no ser lo suficientemente informativo, pero un par de ellos juntos lo serán.
La parte 3 es el resultado lógico de las partes 1 y 2. Si puede amplificar un montón de muestras mixtas juntas y las repeticiones son de longitud variable (por lo tanto, el uso de VNTR o repeticiones similares), entonces las verá como bandas de diferentes tamaños. en un gel.
canadiense
Matemático