Sé que las especies clave son aquellas que juegan un papel crucial en un ecosistema, pero dado que todas las especies son interdependientes entre sí y cada una ocupa su propio nicho, ¿no son todas importantes?
¿Cómo sabes qué organismos son especies clave?
Según la página de wikipedia , una especie clave es:
Una especie clave es una especie que tiene un efecto desproporcionadamente grande en su entorno en relación con su abundancia.
Por lo tanto, podría determinar las especies clave en un ecosistema tomando muestras del tamaño de la población y qué tamaño de 'efecto' tendría la eliminación de la especie del ecosistema. Si estandarizara las unidades de 'efecto' para todas las especies en el ecosistema, las especies clave serían aquellas con el mayor efecto/fracción de población. No sé si hay un tamaño crítico de esta fracción para que una especie se determine como 'clave', pero si lo hay, le permitiría definir explícitamente una especie clave. Esto descartaría el problema de interdependencia que mencionas.
(Publicar una respuesta diferente ya que da un enfoque diferente a la pregunta)
Al volver a leer esto, creo que estabas preguntando cómo inferiríamos experimentalmente estas especies clave.
Como punto de partida, se podría aplicar la inferencia de red sobre el conteo de especies en el ecosistema ( https://doi.org/10.1890/09-0731.1 , https://doi.org/10.1038/s41598-017-07009-x , https ://doi.org/10.1016/j.ecolind.2015.11.031 , como ejemplos). Este tipo de estudio devuelve redes que representan las interacciones entre especies; luego, podría buscar a través de estas redes especies con muchas conexiones en la red. Es probable que la eliminación de una especie con muchas interacciones con muchas otras especies tenga un mayor impacto que la eliminación de una especie con menos interacciones, lo que sugiere que estas son especies clave.
Me doy cuenta de que en su pregunta implica que cada especie tiene una interacción con todas las demás especies en el ecosistema, pero estudios como los anteriores muestran que esto podría no ser cierto. O al menos, muchas de estas interacciones pueden ser indirectas, a través de otra especie.
Después de un estudio de este tipo, podría aplicar métodos estadísticos como la Correlación de Pearson para calcular la "fuerza" de las interacciones en la red. A partir de esto se pudieron identificar especies con muchas interacciones de alta fuerza como piedras angulares. Alternativamente, puede intentar un ajuste de parámetros en la estructura de red aprendida (como puede hacerlo en el caso de las redes bayesianas anteriores), para tratar de predecir qué sucede con la abundancia de otras especies si elimina una de sus 'claves' candidatas.
¡Espero que eso dé un ángulo más experimental sobre cómo resolver esta pregunta!