¿Cómo pueden saber que encontraron a "todos los PERV"? (retrovirus endógenos porcinos)

El artículo del New York Times La edición de genes estimula la esperanza de trasplantar órganos de cerdo en seres humanos enlaza con la reciente publicación de Science Inactivation of porcine endogenous retrovirus in pigs using CRISPR-Cas9 Niu et al. Ciencia 10 de agosto de 2017: eaan4187, DOI: 10.1126/science.aan4187.

La sección resaltada del resumen dice "... inactivamos todos los PERV en una línea celular primaria porcina..." donde un PERV es un retrovirus endógeno porcino, un virus de ARN que lleva su propia molécula de transcriptasa inversa y se convierte en ADN antes incorporación al genoma del huésped.

Pregunta: ¿Quieren decir todos los PERV actualmente conocidos o hay alguna manera de estar absolutamente seguros de que se conocen todos los PERV en el genoma del cerdo? En otras palabras, ¿podrían haberse perdido uno? ¿Podría haber un PERV aún no identificado? Realmente no quiero preguntar sobre la posibilidad de una clase de retrovirus completamente nueva y desconocida; más bien, estoy tratando de entender cómo se pueden identificar todos los PERV tal como se definen actualmente en una línea celular de cerdo.

La razón por la que esto es importante es que la motivación aquí es generar órganos de cerdo para trasplantarlos a humanos. La preocupación es que el genoma del cerdo pueda contener retrovirus que luego podrían infectar al huésped humano, y la posibilidad adicional de que pueda transmitirse de manera infecciosa a otros. Dado que las enfermedades infecciosas entre cerdos y humanos son siempre una preocupación, comenzar con un genoma de cerdo "limpio" tiene una importancia epidemiológica particular.

La primera frase del artículo del NYTimes :

En un avance sorprendente que ayuda a abrir la puerta a los trasplantes de órganos de animales, los investigadores han creado lechones editados genéticamente limpios de virus que podrían causar enfermedades en humanos . (énfasis añadido)

Resumen de Niu et al. 2017 :

El xenotrasplante es una estrategia prometedora para paliar la escasez de órganos para trasplante humano. Además de la preocupación sobre la compatibilidad inmunológica de cerdo a humano, el riesgo de transmisión entre especies de retrovirus endógenos porcinos (PERV) ha impedido la aplicación clínica de este enfoque. Anteriormente, demostramos la viabilidad de inactivar la actividad de PERV en una línea celular de cerdo inmortalizada. Aquí, confirmamos que los PERV infectan células humanas y observamos la transferencia horizontal de PERV entre células humanas. Usando CRISPR-Cas9, inactivamos todos los PERV en una línea celular primaria porcinay generó cerdos inactivados con PERV mediante transferencia nuclear de células somáticas. Nuestro estudio destacó el valor de la inactivación de PERV para prevenir la transmisión viral entre especies y demostró la producción exitosa de animales inactivados con PERV para abordar el problema de seguridad en el xenotrasplante clínico. (énfasis añadido)

Respuestas (1)

Tienes razón, deberían haber escrito "todos los PERV actualmente conocidos" . Aunque la estructura de los ERV generalmente se comprende bien ( https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26104559 ; https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26818261 ), puede haber algunos casos complejos que se han perdido. Además, el mapa del genoma porcino aún no está completamente completo (ni el humano), por lo que no puede estar seguro de que no haya secuencias derivadas de ERV ocultas en las regiones no secuenciadas.

Más intrigante de lo que pensaba Las secuencias derivadas de los ERV constituyen al menos del 8 al 10 % de los genomas humanos y de ratón y van desde secuencias antiguas que son anteriores a la divergencia de los mamíferos hasta elementos que actualmente todavía están activos Mager & Stoye, y "A pesar del estado de herramientas genómicas de última generación disponibles para el descubrimiento de retrovirales y la gran cantidad de secuencias retrovirales descritas hasta la fecha, todavía existen lagunas en la comprensión de los patrones macroevolutivos retrovirales y las interacciones huésped-retrovirus y una falta de una clasificación sistemática coherente, particularmente para los HERV" Escalera-Zamudio & madera verde