Si quiero estudiar, digamos, la respuesta gustativa de los salmones a un ácido biliar, necesito mutagenizar una muestra de machos de salmón. Sin embargo, dado que hay muchos genes implicados en esta respuesta, lo mínimo es que no. de salmones debo mutagenizar, de modo que TODOS los genes involucrados tengan algunas mutaciones?
He buscado bastante algún método estadístico que me diga esto, pero para mi sorpresa no he encontrado ninguno.
No pienses en animales mutagenizados, piensa en genomas mutagenizados. Dependiendo de cuándo se lleve a cabo la mutagénesis y cuán eficiente sea, un número muy pequeño de machos podría dar lugar a miles de progenie F1 mutagenizada, cada una con un genoma mutagenizado único. Ese es el número en el que hay que centrarse. Por lo general, en las moscas de la fruta y los nematodos del suelo, los animales son golpeados "bastante fuerte", de modo que cada F1 lleva cientos, si no miles, de sitios mutados, al azar en todo el genoma. La compensación es no mutagenizarlos tanto como para que sufran una disminución drástica de la fertilidad o la viabilidad, mientras que al mismo tiempo se minimiza la cantidad de homocigotos F2 que tiene para detectar fenotipos.
En C. elegans expuesto a sulfonato de etilmetano 50 mM durante 4 horas, es razonable esperar recuperar 1 mutación con pérdida de función después de examinar 2000 genomas F1 mutagenizados.
¿Existen buenos marcadores genéticos a lo largo de todos los cromosomas del salmón? Si solo está interesado en recuperar mutaciones dominantes, puede seleccionar la F1 directamente (sin embargo, los alelos dominantes tienden a ser mucho más raros que los alelos recesivos, y la interpretación de los fenotipos dominantes es un desafío sin muchas buenas herramientas genéticas, como duplicaciones y deficiencias). De lo contrario, tendrá que aparearse con el F1 para obtener F2 masculino y femenino y luego establecer apareamientos hermano-hermana para que pueda puntuar el F3 para los fenotipos de interés.
Ninguno de estos números se aplicaría al salmón porque el genoma es mucho más grande y, a menos que alguien ya haya realizado una curva de dosis-respuesta sobre la dosis mutagénica óptima para el salmón, primero deberá hacerlo.