Es probable que Scrimgeour haya sido asesinado por funcionarios del Ministerio Imperializado.

Lo más probable es que la forma en que Scrimgeour fue asesinado fue por los funcionarios del Ministerio que estaban Imperius. Yaxley insinúa que este es el plan mientras habla con el Señor Oscuro.

“Sí, mi Señor, eso es cierto, pero como Jefe del Departamento de Cumplimiento de la Ley Mágica, Thicknesse tiene contacto regular no solo con el propio Ministro, sino también con los Jefes de todos los demás departamentos del Ministerio. Creo que será fácil, ahora que tenemos a un oficial de tan alto rango bajo nuestro control, subyugar a los demás, y luego todos podrán trabajar juntos para derribar a Scrimgeour”.
_{^{- Harry Potter y las Reliquias de la Muerte, Capítulo 1 (El Ascenso del Señor Oscuro)}}

Esto también es lo que el Señor Oscuro mismo estaba planeando, ya que dice que era crucial usar a suficientes personas para asegurarse de que el Ministro esté rodeado por su gente antes de que intenten matarlo.

"Es un comienzo", dijo Voldemort. Pero Thicknesse es sólo un hombre. Scrimgeour debe estar rodeado por nuestra gente antes de actuar. Un atentado fallido contra la vida del Ministro me hará retroceder un largo camino”.
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Su plan era usar a los oficiales Imperius para matar a Scrimgeour, que es probablemente lo que hicieron.

Se hizo en silencio, por lo que no sería una invasión abierta de Mortífagos.

Lupin, un miembro de la Orden que habría sido informado de lo sucedido, describió la toma del Ministerio como algo prácticamente silencioso. Esto significaría que el Señor Oscuro y los Mortífagos no habrían ido al edificio del Ministerio para derrocar al Ministro.

“Pero seguro que la gente se da cuenta de lo que está pasando”.

"El golpe ha sido fluido y virtualmente silencioso", dijo Lupin. 'La versión oficial del asesinato de Scrimgeour es que renunció; ha sido reemplazado por Pius Thicknesse, quien está bajo la Maldición Imperius”.
_{^{- Harry Potter y las Reliquias de la Muerte, Capítulo 11 (El Soborno)}}

Aunque algunas personas sospecharon, debido a los cambios en las políticas del Ministerio, que el Señor Oscuro estaba detrás, se mantuvo oculto y no hizo nada para probar abiertamente que se hizo cargo del Ministerio.

“Sin embargo, ese es el punto: susurran. No se atreven a confiar el uno en el otro, sin saber en quién confiar; tienen miedo de hablar, en caso de que sus sospechas sean ciertas y sus familias sean atacadas. Sí, Voldemort está jugando un juego muy inteligente. Declararse pudo haber provocado una rebelión abierta: permanecer enmascarado ha creado confusión, incertidumbre y miedo”.
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Como afirmaban que Scrimgeour renunció y no querían mostrar que se habían apoderado del Ministerio, no podían derrocarlo de ninguna manera que hiciera obvio que lo habían hecho. Por lo tanto, Scrimgeour no habría sido asesinado por el Señor Oscuro o los Mortífagos que se presentaron en el Ministerio para matar al Ministro, ya que entonces sería obvio que lo mataron y realmente no renunció. No habría habido un duelo, al menos no uno donde muchas personas en el Ministerio pudieran verlo.

Kingsley pudo haber estado en el Ministerio en el momento en que cayó.

No se sabe cuántos funcionarios del Ministerio, si es que hubo alguno, trataron de defender a Scrimgeour, pero existe la posibilidad de que Kingsley pudiera haber estado en el Ministerio cuando cayó. Lo supo justo después de que cayera y envió una advertencia, por lo que es probable que estuviera en algún lugar que pudiera saber, posiblemente el Ministerio mismo.

“Entonces la boca del Patronus se abrió de par en par y habló con la voz fuerte, profunda y lenta de Kingsley Shacklebolt.

'El Ministerio ha caído. Scrimgeour está muerto. Ellos estan viniendo."
_{^{- Harry Potter y las Reliquias de la Muerte, Capítulo 8 (La Boda)}}

Era un Auror del Ministerio, por lo que trabajaba allí en ese momento y tendría una excusa razonable para su presencia continua en el Ministerio. Dado que él también estaba en la Orden y sabía que el Señor Oscuro y los Mortífagos estaban tratando de apoderarse del Ministerio, es posible que estuviera tratando de proteger a Scrimgeour cuando cayó el Ministerio, que podría ser la razón por la que supo tan rápido que lo hizo.

Se rumoreaba que Scrimgeour había sido torturado antes de su muerte.

Es posible que Scrimgeour haya sido torturado para obtener información sobre dónde estaba Harry antes de que lo mataran. Aunque nunca se dice si es verdad, Arthur Weasley lo escuchó como un rumor.

“Arthur escuchó el rumor de que intentaron torturar a Scrimgeour para averiguar tu paradero antes de matarlo; si es verdad, él no te delató.
_{^{- Harry Potter y las Reliquias de la Muerte, Capítulo 11 (El Soborno)}}

Dado que los Mortífagos no sabían dónde estaba Harry, Scrimgeour no les dijo a pesar de haber sido torturado, o el rumor no era cierto, pero no está claro cuál es.

Algunas personas en el Ministerio permanecieron sin Imperio después de que cayó.

Había al menos algunas personas que trabajaban en el Ministerio que no permanecieron bajo la Maldición Imperius cuando cayó. Kingsley no estaba impedido, aunque no está claro si se quedó en el Ministerio después de que cayó, ya que la próxima vez que menciona que está en Potterwatch y posiblemente escondido. Arthur Weasley, quien continuó trabajando en el Ministerio después de su caída, tampoco estaba bajo la Maldición Imperius.

“Habían acordado que era demasiado peligroso intentar comunicarse con el señor Weasley mientras entraba y salía del Ministerio, porque siempre estaba rodeado de otros trabajadores del Ministerio. Sin embargo, fue tranquilizador captar estos destellos de él, incluso si parecía muy tenso y ansioso”.
_{^{- Harry Potter y las Reliquias de la Muerte, Capítulo 12 (Magic is Might)}}

Arthur claramente no estaba Imperius, ya que se resiste a las nuevas políticas del Ministerio creadas por el Señor Oscuro.

"Entonces, Dirk Cresswell es diez veces más mago que tú", dijo el Sr. Weasley en voz baja, mientras el ascensor se hundía cada vez más. 'Y si sobrevive a Azkaban, tendrás que responder ante él, sin mencionar a su esposa, sus hijos y sus amigos -"
_{^{- Harry Potter y las Reliquias de la Muerte, Capítulo 13 (La Comisión de Registro de Nacidos Muggles)}}

No está claro cuántos otros funcionarios no estaban Imperius, pero había al menos uno que no estaba bajo la Maldición Imperius y seguía trabajando en el Ministerio después de que cayó.