¿Qué significa "plegamiento local" en la estructura secundaria?

Soy nuevo en el campo de la biología, así que estoy aprendiendo todo tipo de conocimientos de bioquímica para un proyecto de bioinformática. He encontrado algunas definiciones de estructura secundaria en línea. Por ejemplo, encontré esta breve definición aquí:

Una estructura de una molécula biológica caracterizada por el plegamiento local dentro del biopolímero como resultado del enlace de hidrógeno (dentro del biopolímero).

¿Qué significa aquí "plegado local"? Más específicamente, ¿a qué se refiere "local" en este contexto? Gracias de antemano.

Proporcione un enlace a su cotización. Tenemos que ser capaces de verlo en contexto.

Respuestas (1)

Los ejemplos más comunes de estructura secundaria en proteínas son hélices alfa y láminas beta, y la distinción más importante entre estructura secundaria y terciaria es que una sola proteína puede tener múltiples "estructuras locales", hélices alfa y láminas beta, dentro de su estructura global completa. . Por el contrario, una proteína no puede tener múltiples "estructuras globales" por definición.

En otras palabras, una estructura local puede ocurrir varias veces dentro de una proteína, mientras que una estructura global, por definición, solo puede ocurrir una vez y describe la forma completa de la proteína.

Ok, ¿significa un segmento local de la estructura global? Y debido a que la estructura secundaria no especifica la posición exacta de un átomo, ¿es solo una plantilla general para representar lo que es? Y por lo tanto, la estructura secundaria no especifica la función de ese segmento?
Las estructuras secundarias no tienen posiciones específicas en una proteína, pueden ocurrir en casi cualquier lugar dependiendo de la proteína. Sin embargo, las estructuras secundarias a menudo tienen funciones importantes. Por ejemplo, las hélices alfa son útiles para que las proteínas se unan al ADN y para que las proteínas crucen las membranas celulares.
Es interesante saber que la estructura secundaria tiene una función tan genérica. ¿Podría también explicar brevemente por qué las estructuras secundarias pueden ocurrir casi en cualquier lugar?
Es probable que existan algunas restricciones estructurales en las que pueden ocurrir estructuras secundarias, para permitir el plegado y la flexión energéticamente estables, pero no estoy muy familiarizado con ellas. Sin embargo, las estructuras secundarias son muy comunes, ¿por qué? probablemente no haya mejor respuesta que simplemente la evolución los encontró útiles. Es bastante sencillo construir estructuras secundarias, solo necesita asegurarse de que su secuencia lineal de aminoácidos tenga ciertas propiedades bioquímicas, como mucho MALEK: en.wikipedia.org/wiki/Alpha_helix#Amino-acid_propensities
Esto es muy útil para entender lo que está pasando porque he estado leyendo algunos artículos que utilizan estos parámetros para predecir la estructura secundaria.
¡Ningún problema! Encantado de ayudar.