¿Qué es una "tensión de herramienta"?

Cuando un biólogo habla de una cepa de ratón modificada genéticamente que es una "cepa de herramienta", ¿qué significa eso? ¿Cuál es la definición exacta de una tensión de herramienta? ¿Cuál es la diferencia entre una cepa de herramienta y cualquier otra cepa de ratón?

Además, ¿cómo se conectan las cepas de herramientas con las técnicas de recombinasa? ¿El uso de una recombinasa crea automáticamente una tensión en la herramienta? ¿O son las propiedades "deformación de la herramienta" y "deformación que contiene recombinasa" independientes entre sí?

Si es importante, el contexto son las cepas de ratones (y posiblemente otros animales) utilizadas en la investigación del cáncer.

Sería útil si pudiera mantener la explicación de alto nivel. Solo tengo conocimientos de biología de la escuela secundaria y estoy tratando de dar sentido a los requisitos para una aplicación de software para uso de biólogos.

Sería útil si pudiera citar una sección de las instrucciones de ese software porque dichos términos tienden a depender del contexto.
No hay instrucciones. Estoy tratando de obtener requisitos de un solo usuario clave que no "entiende" la teoría de conjuntos. Ella está hablando de varios tipos de modelos de tumores y cepas animales, y cuando me habla de los tipos de modelo A y B, no es capaz de decirme si A es un subtipo de B, B un subtipo de A, ambos son sinónimos, o sin relación. Debido a que siempre está pensando en términos de datos concretos, no puede generalizarlos. Y cuando trato de sacarlo con preguntas enfocadas, ella comienza a contradecirse. Buscar en Google ha ayudado mucho, pero con las tensiones de la herramienta, me topé con una pared.
Por si sirve de algo, me convenció de que "cepas de herramienta" y "cepas de recombinasa" son sinónimos, y que existen otros tipos de cepas no relacionadas, como "cepas de reportero", cepas GE sin recombinasa y cepas no GE. que pueden tener enfermedades espontáneas como A/J, o estar sanos como FVB/N. Luego encontré ejemplos de cepas indicadoras que tenían recombinasa y concluí que mi comprensión es incorrecta. Todavía no sé si una tensión se considera una "tensión de herramienta" en el contexto de un determinado experimento, o si es una propiedad de la propia tensión.
¿Hay alguien más con quien puedas hablar? :) En mi opinión, las cepas de recombinasa podrían ser un subconjunto de cepas de herramientas, ya que una recombinasa como Cre mencionada a continuación es sin duda una herramienta para la ingeniería genética, hay otras "herramientas" que también se pueden usar.

Respuestas (2)

En extensión a la respuesta de shigeta, bien podría imaginar que las "cepas de herramientas" y las "cepas de recombinasa" son equivalentes en el sentido de que significan cepas de ratones cuyo genoma se puede manipular fácilmente.

La recombinasa Cre es una enzima que puede recombinar (insertar de manera efectiva) genes de un plásmido (que de alguna manera le entregaste a la célula) en el genoma de la célula, si hay sitios Lox presentes (recombinación Cre-Lox ) . Este es un método muy común de integrar genes en organismos modelo eucarióticos (es decir, ratones).

Por cepas de herramienta/recombinasa, podrían significar simplemente ratones que ya expresan recombinasa, de modo que pueda insertar fácilmente sus genes en células específicas al administrar un plásmido con los genes y luego activar la recombinasa Cre en las células que desea modificar en orden. para integrar los genes en el genoma de esas células.

Hasta que aparece una respuesta mejor...

Una cepa de herramienta parece ser una cepa de ratón que es útil para producir ratones recombinantes. Tiene genes insertados en su genoma para facilitar la detección de sus manipulaciones. En este caso, se pueden observar varios fenotipos (luciferasa, SMN humano) y se ha colocado un marcador de resistencia a la tetracenomicina para que se pueda estimar fácilmente la descendencia con el gen.

Estos Tg(SMN2)89; Smn1+/-; Tg(SMNΔ7)4299; ROSA26rtTA; Los ratones Luci-TRE-SMN "viejos" permiten que se regulen altos niveles de luciferasa y expresión de SMN humana de longitud completa mediante la adición/eliminación de doxiciclina. Estos pueden ser útiles como un indicador fluorescente y/o tensión de herramienta Tet-On/Tet-Off para el rescate inducible por doxiciclina de la atrofia muscular espinal proximal (AME) de tipo II (moderada).

Siempre he llamado a esos ratones reporteros...
también es un término nuevo para mí. Sin embargo, es un gran ahorro de tiempo porque nunca se sabe cuándo un gen de ratón recombinante se ha cruzado en una nueva generación; de lo contrario, tendría que hacer una PCR y una secuencia de cada ratón que obtenga. Ahora solo necesita validar algunos posibles candidatos.
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