Claramente reconoció al patronus de Tonks como Lupin, a quien le desagradaba intensamente. No está claro si simplemente se burlaba de la idea de que Lupin fuera el Patronus de alguien o se burlaba de la propia Tonks por enamorarse de un hombre lobo.

En cuanto a su propio Patronus haciendo referencia a Lily, estoy seguro de que se sentiría insultado por su insinuación de que esto podría ser remotamente comparable. (Lily == perfecto, Lupin == débil. Tiene mucho sentido desde el punto de vista de Snape).

Curiosamente, cuando Harry es testigo de la escena, piensa que el Patronus de Tonks es Canuto, pero la burla de Snape es igual de creíble.

Lo dijo porque su Patronus coincidía con alguien a quien odiaba.

Snape no desaprobaba el hecho de que su Patronus cambiara porque estaba enamorada. Él desaprobaba específicamente de quién se enamoraba ella.

“Él cerró las puertas en su cara con un fuerte sonido metálico y golpeó las cadenas con su varita de nuevo, de modo que se deslizaron, tintineando, de vuelta a su lugar. 'Creo que estabas mejor con el viejo,' dijo Snape, la malicia en su voz era inconfundible. "El nuevo parece débil".
_{^{- Harry Potter y el Misterio del Príncipe, Capítulo 8 (Snape Victorious)}}

No habría necesitado Legeremancia para darse cuenta de lo que estaba pasando. Probablemente sabría lo mismo que Lupin le explica a Harry, que un Patronus puede cambiar debido a un trastorno emocional, incluso si él personalmente no tuvo un Patronus corpóreo antes de que el suyo fuera un ciervo como el de Lily.

“El Patronus de Tonks ha cambiado de forma”, le dijo. 'Snape lo dijo, de todos modos. No sabía que eso podía pasar. ¿Por qué cambiaría tu Patronus?'

Lupin se tomó su tiempo para masticar su pavo y tragar antes de decir lentamente: "A veces... un gran shock... un trastorno emocional..."
_{^{- Harry Potter y el Misterio del Príncipe, Capítulo 16 (Una Navidad muy helada)}}

Después de ver que su nuevo Patronus era un lobo , no es un gran salto lógico conectarlo con Lupin, el hombre lobo. Además, podría haber visto el Patronus de Lupin y reconocido que el de Tonks coincidía. También es posible que Snape haya oído hablar de sus sentimientos por Lupin de alguna manera; los padres Weasley ciertamente parecían saberlo.

Harry sospechaba que Tonks estaba enamorado, y no solo no era un Legeremista, sino que ni siquiera era particularmente observador. Incluso si Snape se las arregló para hacerlo completamente mal, como lo hizo Harry, podría haber pensado que era Sirius, a quien también odiaba.

"¿No crees que ella pudo haber estado... ya sabes... enamorada de Sirius?" Hermione lo miró fijamente.

'¿Qué diablos te hace decir eso?'

'No lo sé', dijo Harry, encogiéndose de hombros, 'pero estuvo a punto de llorar cuando mencioné su nombre... y su Patronus ahora es una gran cosa de cuatro patas... Me preguntaba si no se había convertido en... ya sabes... él.'
_{^{- Harry Potter y el Misterio del Príncipe, Capítulo 21 (La Habitación Incognoscible)}}