En Star Wars 3, después de que se diera la Orden 66, las tropas clon seguían su cadena de mando al servicio del comandante y jefe de la República, el Canciller Palpatine. Si su propósito era servir y defender a la República, independientemente del levantamiento jedi falso (en el que creían que estaban siguiendo órdenes), ¿por qué los clones no recurrieron a Palpatine para defender la República cuando la convirtió en un Imperio Galáctico? ¿Fue porque la formación del Imperio fue votada por el Senado (donde Padme dijo: "Así es como muere la libertad, con truenos y aplausos")?
Me limitaré a lo que sabemos de las películas y los dibujos animados de los clones. Fueron criados para ser siervos. Seguir órdenes y proteger a la república de todos sus enemigos (y la orden implantada 66 aseguraba incluso contra los jedi si fuera necesario).
Los pocos que probablemente se rebelaron a un lado (vimos en la serie que de vez en cuando los soldados clon individuales se rebelaron y lucharon contra sus antiguos camaradas o huyeron) todos sirvieron a la república y su voluntad.
Cuando el canciller dejó votar a los senadores usó el sistema de la república en su contra. Si hubieran echado abajo el voto hubiera perdido y no se hubiera podido crear el imperio sin que los clon troopers tuvieran que hacer algo contra eso pero si hubiera ganado el voto la republica desechara su nombre y el nombre del cargo de canciller y hubiera sido la VOLUNTAD de la república hacerlo.
Además, a pesar de que cambió el nombre de su posición y la república, ¡todavía era la república en ese momento hasta que el senado se disolvió casi 20 años después! Con eso en mente, aparte de los cambios de nombre y algunos cambios burocráticos desde la perspectiva de los soldados clon, nada cambió realmente. Siguieron la voluntad de la república cuando no actuaron en contra del cambio de nombre y aparte de eso, TODAVÍA era la república para ellos (solo que ahora se llama el imperio).
Así que no hay motivo para que se rebelen.
El comando de la Orden 66 era apuntar a los Jedi y matarlos. Palpatine no era un Jedi, por lo que esta orden no provocaría que los Clone Troopers lo atacaran. De hecho, le da un mando temporal sobre ellos.
Orden 66 : En el caso de que los oficiales Jedi actúen en contra de los intereses de la República, y después de recibir órdenes específicas verificadas como provenientes directamente del Comandante Supremo (Canciller), los comandantes GAR eliminarán a esos oficiales con fuerza letal, y el mando del GAR volver al Comandante Supremo (Canciller) hasta que se establezca una nueva estructura de mando.
luan
Tomás