Ciertos procariotas son poliploides. Por ejemplo, Thermus thermophilus tiene unas cinco copias de su genoma ( http://jb.asm.org/content/192/20/5499.full ). Un poliploide extremo, Epulopiscium fishelsoni , tiene decenas de miles de copias de su genoma ( http://www.pnas.org/content/105/18/6730.full ). (Algunos eucariotas también son poliploides).
Como cada copia se replica por separado, parece probable que surjan mutaciones espontáneas y con el tiempo, y tal organismo se convierta en un híbrido de muchos genomas distintos que coexisten en una sola célula. Este parece un lugar ideal para que surjan copias egoístas (aunque quizás no más que cualquier otro organismo; creo que he leído que incluso los procariotas son propensos a los parásitos plásmidos).
Entonces, ¿esto sucede? ¿Si no, porque no? ¿Existe algún mecanismo de verificación de copias (algunos extremófilos parecen tener un mecanismo de reparación del ADN) o algún mecanismo que inhiba la reproducción de genomas que (de alguna manera) están determinados a no contribuir al metabolismo general de la célula?
En resumen, ser haploide o poliploide no debería protegerte de Selfish Genetic Elements (SGES).
Casi todos los eucariotas son poliploides. Las plantas son el ejemplo más citado. El trigo, creo, es hexaploide, por ejemplo. Las bacterias poliploides son las excepciones típicamente (si consideramos que la ploidía es de todo el genoma). Sin embargo, incluso en bacterias verdaderamente haploides, el genoma de cualquier célula dada suele replicarse activamente, por lo que algunos de los genes están presentes más de una vez.
Independientemente, la replicación y reparación es un proceso muy bien controlado y regulado: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1479556/
Los SGE pueden tomar muchas formas según su definición y, por lo que podemos decir, son de naturaleza ubicua. Los plásmidos que albergan factores de adicción, elementos de inserción, transposones, profagos, etc. son todos técnicamente SGE. Vea aquí una revisión: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21227262
No puedo encontrar ninguna literatura sobre SGE en poliploidía directamente, pero está bien documentado que las bacterias albergan una cantidad considerable de ADN egoísta; parece probable que esto sea igual, si no peor, en poliploidía. La detección de plásmidos es un proceso computacional y experimental difícil ( http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/early/2016/11/18/bioinformatics.btw651.full ), pero una de las características de las secuencias de plásmidos son típicamente factores de adicción (un gen que la célula huésped debe mantener para sobrevivir (por lo general, una antitoxina para neutralizar una toxina presente en una molécula de ADN diferente), así como genes de fagos.
Para abordar un par de cosas específicamente:
Como cada copia se replica por separado, parece probable que surjan mutaciones espontáneas y con el tiempo
Esto es algo cierto, siempre hay una variación menor en una población (¡de lo contrario, la evolución no funcionaría!). A veces encontrará que este también es el caso en una sola celda, pero con menos frecuencia. Todas las células que hemos encontrado hasta ahora tienen mecanismos de replicación y reparación de ADN: https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_repair . Sin embargo, la frecuencia de mutación en el genoma no está directamente relacionada con la cantidad de elementos egoístas, lo que hace que su segundo punto sea polémico:
Este parece un lugar ideal para que surjan copias egoístas.
Estoy de acuerdo con la premisa de que la poliploidía probablemente invite a más SGE (pensando específicamente en elementos IS y transposones aquí realmente), pero no debido a la mutación, sino solo porque hay más moléculas de ADN y sitios presentes para que esos elementos se incorporen.
joe healey
Remi.b
jim davis