¿La proteína de unión al ARN de MS2 tiene algún efecto de represión de la traducción?

Reenviado de Quora: http://www.quora.com/Does-the-MS2-RNA-binding-protein-have-any-translational-repression-effects

Estoy pensando en la unión de la proteína MS2 a su objetivo de horquilla de ARN. ¿La interacción de la proteína MS2 con la horquilla colocada aguas arriba de un ORF causaría alguna represión traduccional?

¿Por qué no coloca el MS2L aguas abajo del ORF? ¿Cuál es exactamente el experimento que quieres hacer?

Respuestas (1)

Supongo que está hablando de la técnica de visualización mTAG para ARNm (1) . Probablemente esté familiarizado con él, pero el OFR de interés está etiquetado con la secuencia MS2L aguas abajo y aguas arriba de la 3'UTR. También hay una versión modificada, en la que puede visualizar tanto el ARNm de interés como la proteína que se traduce, vea la figura a continuación (2) . Haim y sus colegas encontraron que la levadura que expresaba mCherry y ATP2 etiquetado con MS2L crecía en medios que contenían glicerol, lo que requeriría una traducción eficiente de ATP2.

ingrese la descripción de la imagen aquí

Así que asumiría que no hay represión traduccional si etiqueta el ARNm aguas abajo del ORF. A menos que tenga una muy buena razón para etiquetar el ORF de interés con MS2 aguas arriba del codón de inicio, no lo haría, porque estas estructuras de bucle de tallo muy probablemente detendrían la traducción, ya que la estructura secundaria del ARNm se ha implicado en el inicio de la traducción. eficiencia.

La idea en realidad sería reprimir la traducción a través del mecanismo que sugieres. Por lo tanto, la lógica de colocar la horquilla MS2 aguas arriba del ORF.
Oh, ya veo... Interesante idea. Vale la pena explorar. ¿Por qué no usas Cas9?
Probablemente porque hice esta pregunta en 2012 y era más una pregunta de curiosidad que una pregunta experimental real. Más específicamente, me preocupa más generar un tipo de sistema de represión analógico sintonizable en el que pueda generar un rango de represión en lugar de realizar una caída completa usando CRISPR.
¿La proteína de unión al ARN de MS2 tiene algún efecto de represión de la traducción?
RespuestasAquíPolítica de privacidad1y, 0v