El proceso de traducción comienza cuando el ARNt iniciador identifica el codón que codifica la metionina (AUG). Sin embargo, mi libro de texto también dice que hay varias regiones no traducidas presentes en el ARNm. Fue entonces cuando se me ocurrió esta pregunta. ¿Cómo diferencia realmente el ARNt entre las regiones que deberían codificarse y las que no? Se puede decir que la traducción siempre comienza con la metionina, pero mi pregunta es diferente. Por ejemplo, si el código es
5'...GUAUGCAUGAU...3'
luego, cuando llega el tRNA, ¿de cuál de ellos lee? ¿Omite los dos primeros nucleótidos y los lee como AUG CAU GAU y así sucesivamente o omite los primeros seis nucleótidos y los lee como AUG AUC y así sucesivamente?
Existen diferentes procesos para reconocer el sitio iniciador en procariotas y eucariotas.
En los procariotas, el proceso se basa en la secuencia de Shine-Dalgarno, esta es una secuencia bien conservada en todos los procariotas que se encuentran aguas arriba del codón de inicio. Interactúa con el ARN ribosomal 16s para colocar el codón iniciador en el sitio A del ribosoma.
En los eucariotas, el proceso es algo más complejo y se basa en un gran complejo proteico que se ensambla en la tapa 5' de los ARNm. Este complejo media una interacción entre el ARNm y el ribosoma, el ribosoma luego escanea (usando GTP para energía) 5' a 3' para detectar el codón de inicio.
Un proceso final que es inusual pero que ocurre es la iniciación independiente del capuchón mediada por sitios de entrada de ribosomas internos (IRES). Estas son secuencias que forman bucles estructurados que pueden imitar las interacciones formadas normalmente por el complejo cap. Estas secuencias aparecen en los ARNm virales, lo que permite que los virus eludan los mecanismos antivirales en las células.
Necesitará hacer una lectura razonablemente extensa si quiere comprender completamente estos procesos y cómo pueden ser manipulados por las células para alterar la expresión.
David