¿Herramientas basadas en la web para documentar estudios?

Me interesa cómo se podría hacer ciencia abierta en psicología. ¿Existen buenas herramientas basadas en la web que puedan albergar y compartir un estudio? Cuando digo "estudiar" me refiero a:

  • Notas de laboratorio de la recopilación de datos.
  • Datos sin procesar
  • Código para análisis
  • Resultados
  • Discusión del proceso de investigación y los resultados (idealmente abierto a la comunidad)
  • Afiches, Presentaciones, Publicaciones

En este momento, todo lo que he visto hecho (y mi mejor idea) sería una combinación de Wiki para el cuaderno de laboratorio, almacenamiento en la nube (por ejemplo, Google Drive) para los datos, github (o similar) para el código, blogs para discusión, y un sitio web personal para versiones archivadas de artículos de revistas, carteles y presentaciones.

Josué, bienvenido al sitio! Ha planteado algunas preguntas interesantes, pero, como sospechaba, esto se desvía un poco del formato de preguntas y respuestas en Exchange. No temas, puedes editar tu pregunta tanto como sea necesario. Trate de enfocar esto en 1 o 2 problemas muy específicos que alguien con conocimientos en el campo pueda responder. Se desaconsejan en gran medida las "discusiones" como las que podría tener en un foro tradicional, donde todos comparten sus anécdotas personales. A medida que lo reformula, podemos volver a etiquetar según sea necesario.
@ChuckSherrington Gracias por el consejo. Con suerte, esto es un poco mejor (aunque sospecho firmemente que la respuesta a la pregunta formulada ahora es "No"). Tal vez no tenga una buena pregunta para el Exchange.
Esto es genial, en realidad. Guarde algunas de esas otras ideas para hacer otras preguntas también.
¡Bienvenido al sitio, @Joshua! Algunas de estas preguntas/respuestas pueden brindarle instrucciones iniciales: herramientas de colaboración , organización de datos y wikis de laboratorio .
Otra pregunta relacionada de Cross Validated.

Respuestas (5)

Open Science Framework hará algo de lo que pides . Además, te permitirá prerregistrar tus hipótesis para distinguir adecuadamente la investigación confirmatoria de la exploratoria.

Características (citado de la página de inicio).

  • Estudios de documentos y archivos
  • Comparta y encuentre materiales, guiones, datos
  • Detalle aportes individuales
  • Aumentar la transparencia
  • Materiales de sello de tiempo
Las hipótesis preregistradas son geniales. La verdad es que me gusta mucho la idea. Esto es más o menos exactamente lo que esperaba (si no es la escala que esperaba).

Me gusta tu pregunta. Pero debo señalar una cosa: si usara herramientas de documentación para todas las tareas que mencionó, no le quedaría mucho tiempo para su investigación. Compartir es excelente, pero lleva tiempo hacerlo correctamente, incluso con excelentes herramientas.

Probé bastantes herramientas para documentar la investigación, con la idea de aumentar mi productividad, aumentar la cantidad de información registrada y compartir la información para la crítica de los compañeros. Al final del día, solo sobrevivió un pequeño puñado de esas herramientas. Los que sobrevivieron fueron los que se integraron sin problemas con mi rutina diaria, principalmente en términos de eficiencia de tiempo y simplicidad de interfaz.

Para las notas de laboratorio, pensamientos rápidos, bocetos brutales, pequeñas lluvias de ideas y garabatos rápidos de conferencias, el ganador es un cuaderno de papel de buena calidad . Personalmente, soy fanático del diario de papel reciclado marrón A5 de Paperchase con encuadernación de alambre, que siempre uso con un bolígrafo Pilot de tinta negra fina. Lo sé, TOC, pero en el buen sentido. El papel marrón le da esa cualidad vintage a mis notas, lo que de alguna manera es estimulante para mí, y me gusta volver a él y guardarlo. Probé alternativas, pero nunca pudieron vencer al papel marrón encuadernado. El bolígrafo Livescribe era demasiado grande, tenía una tinta fea y carecía de la suavidad de la exportación del software y terminó siendo solo una grabadora de voz, aunque rara vez. Aplicaciones para tomar notas en el iPad como Noteshelf o Penultimatecon el lápiz óptico Pogo realmente me ralentizó, la escritura fea de nuevo, y la batería siempre se agotaba en medio de un seminario importante.

Con frecuencia tomo instantáneas de mi libreta de papel con Evernote usando iPhone. De hecho, tomo instantáneas de muchas otras cosas usando Evernote y esta es definitivamente una plataforma de almacenamiento/uso compartido muy simple y excelente, que funciona sin problemas entre la computadora de escritorio y el dispositivo móvil.

Para los datos sin procesar: Dropbox . Ahora, también Google Drive , como usted señaló, pero Dropbox fue el primero, con una solución de almacenamiento de configuración súper simple basada en la nube. Dropbox fue una gran cosa en mi caja de herramientas de documentación, ya que eliminó la necesidad de llaves USB. Podría configurar mi experimento para guardar automáticamente todos los datos sin procesar del participante en Dropbox después del experimento. Regresé a casa, estaba allí esperándome. Cuando colaboramos, todos los datos se compartieron muy bien en carpetas colectivas de Dropbox sin necesidad de mezclar correos electrónicos o configurar transferencias con datos sin procesar.

Mendeley es una gran herramienta tanto para administrar como para compartir bibliografía. Fantástica idea que resultó realmente grande y supera a EndNote. Lo más importante que me encanta de Mendeley es la capacidad de automatizar la creación de bibliografías para LaTeX. Este es un ahorro de tiempo definitivo.

En cuanto a los carteles, existe este nuevo repositorio de carteles F1000 que no he probado, pero parece prometedor.

Para el código de análisis lo encontré complicado. Sí, puedes poner el código en Github , pero no puedes compilarlo allí. Entonces, existe este paso adicional cuando tienes que organizar tu código en Github, describirlo, etc. Nunca lo probé porque prefiero dedicar tiempo a aprender más sobre codificación, pero no digo que no lo intentaré en el futuro. , cuando sentiré que tengo un código más valioso para compartir con la comunidad.

Para la presentación, jugué con Prezi durante algún tiempo, que tiene una opción genial para compartir tus presentaciones fácilmente. Pero finalmente lo abandoné, después de que la gente se quejara del mareo por movimiento y después de que sentí que perdí un factor clave de simplicidad. Estoy pendiente de Beamer , pero ahora no hay tiempo, por lo que Keynote tiene que ser suficiente.

En cuanto a la discusión, el chat, el monólogo inteligente, nuevamente depende de lo que quieras lograr con él. ¿Comparte un truco de codificación para analizar algunos datos? ¿Discutir algunos datos interesantes? ¿O escribir una página sobre los enfoques de su caja de herramientas de documentación? En todos los casos requiere tiempo, por lo que es bueno asegurarse de no hacerlo para evitar hacer algo más importante. Las herramientas para la discusión en línea y los blogs son numerosas. Me gusta aquí en Stack Exchange, porque es puramente impulsado por la comunidad y es muy fácil armar una diatriba demasiado larga sobre muchos temas ;-)

¿Evernote hace reconocimiento óptico de caracteres? Es decir, ¿puedo hacer ctrl-fs en las imágenes acumuladas para encontrar parte del texto dentro de ellas? ¿O tiene que etiquetar cada instantánea de su computadora portátil manualmente?
Buenos pensamientos. Creo que para estudios más grandes, a menudo tiene que haber documentación de todos modos (para estandarizar intervenciones, etc. entre diferentes miembros del personal que trabajan en el proyecto o en múltiples sitios). Parte de lo que imaginé que sería en última instancia proyectos como ese, no per se un pequeño estudio que dirijo yo solo. Beamer es muy agradable, pero también puede consultar las diapositivas HTML5. He visto algunas cosas muy interesantes con Markdown (que es relativamente fácil) tanto para HTML como para crear archivos PDF.
@ArtemKaznatcheev: Sí, puede hacerlo, pero necesita una cuenta premium para esta función .

Figshare es una opción para archivar una variedad de artefactos de investigación. Para citar la "página acerca de" :

figshare permite a los investigadores publicar todos los resultados de su investigación en segundos de una manera fácil de citar, compartir y descubrir. Se pueden publicar todos los formatos de archivo, incluidos videos y conjuntos de datos que a menudo se degradan a la sección de materiales complementarios en los modelos de publicación actuales. Al abrir el proceso de revisión por pares, los investigadores pueden publicar fácilmente resultados nulos, evitando el efecto de cajón de archivos y ayudando a que la investigación científica sea más eficiente. figshare utiliza licencias creative commons para permitir el intercambio sin fricciones de datos de investigación al mismo tiempo que permite a los usuarios mantener su propiedad. figshare brinda a los usuarios espacio público ilimitado y 1 GB de espacio de almacenamiento privado de forma gratuita.

Algunas cosas que me gustan de figshare:

  • licencia creative commons
  • Tienen algún tipo de política de archivo que dice que si cierran, el contenido será respaldado por otro proveedor. Sin embargo, no es tan abierto como el intercambio de pila en el sentido de que no hacen que las copias de seguridad públicas de todo el sitio estén disponibles.
  • Los objetos obtienen un doi citable
  • Ver y compartir estadísticas de objetos compartidos

El sitio http://psychfiledrawer.org/ también aborda algunos aspectos de lo que está preguntando. Está orientado principalmente a mantener un repositorio público de intentos de replicación de experimentos psicológicos.

He visto eso. Es una buena idea que, con suerte, se populariza más.

Muchos laboratorios que conozco usan Basecamp . Cuesta dinero , pero proporciona un lugar centralizado para almacenar toda la información que enumeró y permite comentarios sobre todo ello, así como un calendario para coordinar su equipo.