¿Existe una base de datos de cariotipos para líneas celulares humanas?

Estoy buscando el cariotipo de una línea celular específica. Algunos cariotipos son bien conocidos, como HeLa o algunos carcinomas, pero algunos son muy difíciles de encontrar, como LG2 (células B). ¿Existe una base de datos dedicada a los cariotipos de líneas celulares humanas?

No puedo encontrar la línea celular LG2 que mencionó, pero a menudo puede encontrar información sobre el cariotipo en ATCC o COSMIC (para células cancerosas)
¿Has revisado el siguiente enlace? Sin embargo, se centra en las células epiteliales. antiguo-www.path.cam.ac.uk/~pawefish

Respuestas (1)

Por lo que sé y he descubierto, no existe una base de datos maestra para los cariotipos de todas las líneas celulares humanas. Por lo general, se agrupan en subconjuntos ya sea por algo en común (por ejemplo, cánceres) o simplemente por quién/dónde se desarrollaron y cómo eligieron compartir la línea. Algunas buenas bases de datos/recursos son:

  1. ATCC : un gran repositorio que tiene hojas de datos de líneas celulares, referencias, imágenes e información de cultivo. Recomiendo encarecidamente usar ATCC como su primera parada cuando busque obtener más información sobre una línea.
  2. Repositorio de células genéticas humanas NIGMS : un repositorio muy robusto que contiene mucho más que solo líneas celulares. Es bueno, pero la gran cantidad de información puede ser un poco difícil de analizar.
  3. COSMIC : una gran colección de información sobre líneas celulares y mutaciones que se encuentran dentro de ellas. Bueno si quieres buscar/comprender aspectos genéticos particulares de una línea.
  4. Cellosaurus - ¡Una fantástica base de datos sobre líneas celulares! Me gusta especialmente la información que alberga Cellosaurus sobre los diferentes nombres y las faltas de ortografía comunes de los nombres de las líneas celulares. También proporciona información sobre jerarquías de líneas celulares, es decir, cuando varias líneas celulares se derivan de una línea principal. Esto es muy útil cuando se trata de analizar literatura con referencias confusas a líneas similares. También proporciona referencias y referencias cruzadas. No puedo recomendar este lo suficiente.

Para volver a su línea celular en particular, solo pude encontrar una referencia a una línea llamada 'LG2', incluso con la ayuda de los recursos enumerados anteriormente y PubMed , por lo que, lamentablemente, no puedo brindarle mucha información. en eso específicamente. Si realmente hay tan poca información en esta línea, le sugiero que se comunique con la fuente (colega, laboratorio, hoja de Excel asociada con su sistema de almacenamiento, etc.) de sus celdas para ver qué información tienen. Si no puede encontrar nada de esa manera, puede ser mejor enviar una muestra para secuenciar usted mismo y obtener esa información.