En las últimas escenas de Skyfall cuando Silva encuentra a M en la capilla, mira a su alrededor y habla.
¡Por supuesto! tenía que estar aquí. Tenía que ser así.
¿De qué estaba hablando? ¿Se refería a algo que solo él y M sabían?
No se trata de algo que solo él y M sabían, se trata del lugar y la situación en la que se encontraban.
Silva odiaba toda la institución del MI6 de la que M era el Jefe. Su odio por M era mucho mayor ya que M era una figura materna para él. Más tarde fue sacrificado por su organización para el intercambio de seis prisioneros en China y responsabilizó a M por ello.
Para Silva, eso (la madre abandonando a su hijo) era un pecado. También son pecados dar órdenes a los agentes para que maten a las personas.
.....y enviándole un mensaje aconsejándole que "piense en sus pecados" antes de bombardear su oficina...
Entonces, cuando se encuentran por última vez, Silva ve que es en una capilla. Él sabe que él (el niño) ha cometido y aún cometerá un pecado (matar a M) y M también ha cometido muchos. Piensa que no podría ser mejor que una capilla donde el que ha cometido pecados obtendrá justicia y misericordia a la vez. Por eso dice,
¡Por supuesto! tenía que estar aquí. Tenía que ser así.