¿Cuántos genes tiene D. melanogaster?

Obviamente, no hay un número exacto al 100%, pero me encontré con esto en flybase , el estándar de oro para la anotación. Yo estoy confundido ahora. "Genes ubicados en el genoma", ¿es eso lo que estoy buscando? Si es así, ¿qué significa "Genes no ubicados en el genoma"?

Supongo que los genes que no están ubicados en el genoma son los que no se pueden mapear en un cromosoma en particular, pero son parte de algún contig no mapeado. Puede verlo en el archivo GTF, pero la cifra no coincide con las estadísticas que se muestran aquí . De hecho, la página de estadísticas informa un total de 32078 registros de genes, pero el GTF solo tiene 17716 (que es lo mismo que los genes ubicados en el genoma , incluidos los cóntigos y las mitocondrias no mapeados). Así que supongo que los otros genes solo están presentes en el ensamblaje del transcriptoma y no están asignados a ningún contig del genoma.
@WYSIWYG está relacionado con genes y fenotipos de la literatura antes de tener el genoma secuenciado.

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Correspondencia personal al representante en FlyBase.org

En FlyBase hemos recopilado información sobre genes y fenotipos durante más de 20 años, incluida información de artículos y recursos anteriores. Anotamos modelos de genes en el ensamblaje del genoma de Drosophila melanogaster y, cuando es posible, asociamos esas anotaciones con otra información (por ejemplo, fenotipo, función, etc.) que se conoce sobre el gen. Sin embargo, en algunos casos, especialmente para genes y fenotipos que se describieron en la literatura más antigua antes de que se secuenciara el genoma, todavía tenemos información sobre esos genes, pero no hemos podido asociar esa información con una anotación del genoma. Esos son lo que llamamos genes no localizados (es decir, aquellos sin una anotación en el genoma).

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